In diesem Video zeigen wir Ihnen, wie Sie die Daten Ihres Inkubator-Überwachungssystems CM20 analysieren können.
Klicken Sie zum Start links auf die Registerkarte „Analyseeinstellungen“.
Klicken Sie auf „Neu“, um die Analyseparameter auszuwählen.
Wenn Sie eine Mikrotiterplatte verwenden, wählen Sie den Wachstumsbereich, den Sie zuerst analysieren möchten, bevor Sie auf „Neu“ klicken.
Klicken Sie im Dropdown-Menü zur Auswahl der Passage auf „Letzte“.
Das Dialogfenster zum Einstellen der Analysedaten wird angezeigt.
Wir erstellen zunächst die Analyseparameter für adhärente Zellen.
Wir definieren die Einstellungen für die Berechnung der Zellkonfluenz und der Zellzahl.
Um die aufgenommenen Bilder anzuzeigen, wählen Sie die Überwachungsposition.
Um die Zellkonfluenz zu analysieren, beginnen Sie mit dem Zeichnen von Linien auf den Zellen und auf dem Hintergrund.
Bei Bedarf können Sie das Bild mit dem Mausrad vergrößern,
um die Zellen und den Hintergrundbereich besser zu sehen.
Nachdem einige Zellen und Hintergrundbereiche identifiziert sind, klicken Sie auf „Lernen starten“.
Das System nutzt seinen maschinellen Lernalgorithmus, um zwischen Zellen und Hintergrund zu unterscheiden.
Falls erforderlich, können Sie Linien hinzufügen und diesen Schritt wiederholen.
Klicken Sie auf „Übernehmen“, wenn der Algorithmus die Zellen korrekt identifiziert hat.
Stellen Sie zur Analyse der Zellzahl den Schwellenwert ein, indem Sie den Schieberegler bewegen,
bis nur ein einzelner hellblauer Punkt pro Zelle vorhanden ist. Klicken Sie dann auf „Übernehmen“.
Wenn Ihre Zellen nicht korrekt identifiziert werden, können Sie eine Feineinstellung der Zählschwelle vornehmen.
Scrollen Sie nach unten, um den erstellten Analyseparameter zu speichern, indem Sie einen Namen eingeben und auf „Speichern“ klicken.
Klicken Sie auf „Übernehmen“, wenn Sie den Parameter aus der Liste ausgewählt haben, und dann auf „Analyse starten“.
Wir erstellen nun die Analyseparameter für iPS- oder ES-Zellen.
Zum Messen der Koloniekonfluenz
legen Sie die Zellen und den Hintergrund genauso fest wie zuvor für adhärente Zellen.
Zellzahl und Koloniegröße können berechnet werden, indem der Schieberegler zur Erkennung jeder Kolonie entsprechend eingestellt wird.
Wenn Sie fertig sind, klicken Sie auf „Übernehmen“.
Speichern Sie die erstellten Analyseparameter als Einstellungsdatei.
Sie können dann die Analyse starten, indem Sie den gewünschten Analyseparameter auswählen.
Sie können Ihren Bericht über die Registerkarte „Export“ auf der linken Seite anzeigen.
Hier können Sie einen Projektbericht anzeigen,
Daten in einem CSV-Format herunterladen,
Bilddaten für das gesamte Bild oder eine Analyseposition herunterladen
oder Projekteinstellungen anzeigen.
Klicken Sie auf „Gesamten Bereich herunterladen“.
Den Fortschritt beim Herunterladen der Daten können Sie anzeigen, indem Sie auf das Download-Symbol oben rechts klicken.
Markieren Sie das Kontrollkästchen neben einer erstellten Datei und klicken Sie auf „Herunterladen“, um die Daten zu speichern.
Mit dem Überwachungssystem CM20 behalten Sie auf einfache Weise den Überblick über Ihre Daten.
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