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Descripción

	Estación modular para cribado de alto contenido dedicada a las ciencias de la vida La plataforma modular microscópica de procesamiento de imágenes scanR, permite la adquisición de imágenes y el análisis de datos de muestras biológicas de forma totalmente automatizada gracias a la tecnología de aprendizaje profundo (Deep Learning). Contáctenos

Estación modular para cribado de alto contenido dedicada a las ciencias de la vida

La plataforma modular microscópica de procesamiento de imágenes scanR, permite la adquisición de imágenes y el análisis de datos de muestras biológicas de forma totalmente automatizada gracias a la tecnología de aprendizaje profundo (Deep Learning).

Contáctenos

Hardware (instrumentación) flexible y modular

La estación de cribado scanR combina la modularidad y la flexibilidad de una configuración microscópica dotada de las capacidades necesarias de automatización, rapidez y rendimiento para el cribado de alto contenido. El diseño modular, pensado para la ejecución de ensayos estándar y el desarrollo de estos mismos, hace que la estación scanR se adapte a las aplicaciones de laboratorio de I+D o entornos multiusuario.

Sistema confocal de disco giratorio

Compatible con el sistema microscópico de súper resolución IXplore SpinSR de Olympus y el escáner Yokogawa CSU-W1 integrado.
Presenta discos basados en microlentes que conjuntamente a la excitación láser proporcionan una calidad de imagen confocal perfecta a alta velocidad.

Sistema robótico de carga

Sistema de carga robótico

Posibilidad de uso con un sistema de carga robótico para placas a fin de automatizar el cribado de alto contenido.

Sistema de incubación

Agregue un sistema de incubación compatible con el microscopio IX83 para
un control riguroso de los niveles de temperatura, humedad y CO_^2.

Sistema TIRF y FRAP (con el software cellSens)

Posibilidad de uso con la serie IXplore de Olympus y el software cellSens para llevar a cabo experimentos avanzados de procesamiento de imágenes como TIRF y FRAP.

Videos asociados	Software completo El diseño flexible del sistema permite cumplir con los requisitos del procesamiento de imágenes cuantitativo y el análisis de imágenes en los ámbitos de biología celular, biología molecular, biología de sistemas e investigación médica. Adquisición de imágenes y análisis de datos completamente automatizados para muestras biológicas Diseño que soporta placas multipocillo, portaobjetos y juegos personalizados Potente módulo analítico para ensayos funcionales biológicos Idóneo para desarrollar ensayos y el cribado de alto contenido Admisión de células vivas y fijas

Software completo

El diseño flexible del sistema permite cumplir con los requisitos del procesamiento de imágenes cuantitativo y el análisis de imágenes en los ámbitos de biología celular, biología molecular, biología de sistemas e investigación médica.

Adquisición de imágenes y análisis de datos completamente automatizados para muestras biológicas
Diseño que soporta placas multipocillo, portaobjetos y juegos personalizados
Potente módulo analítico para ensayos funcionales biológicos
Idóneo para desarrollar ensayos y el cribado de alto contenido
Admisión de células vivas y fijas

Cobertura de los requisitos de varios ensayos

El sistema scanR destaca en las aplicaciones de descubrimiento de fármacos/medicamentos, ya que muestra los efectos bioquímicos de los compuestos a nivel celular y los cambios inducidos por fármacos en los niveles de expresión genética. Esta solución puede medir apoptosis, micronúcleos o fragmentación del ADN (ensayos cometa) y cubre una amplia gama de aplicaciones de cribado:

Recuento celular
Expresión genética
Desplazamiento intracelular
Translocación
Proliferación celular
Ensayos en cuerpo con leucemia promielocítica (LPM)
Pruebas de infecciones bacterianas y virales
Análisis de ciclo celular
Exámenes de matrices celulares
Localización y colocalización de proteínas
Ensayos de células vivas, como el análisis cinético y el control de las curvas de respuesta resultantes
Pruebas multicromáticas
Análisis de eventos poco comunes
Análisis automatizado por FISH
Análisis de fluorescencia en cortes tisulares
Migración celular

Cribado en todo el genoma de matrices celulares para identificar genes noveles implicados en la maquinaria de transporte intracelular. Imagen por cortesía del Dr. R. Peperkok, EMBL, Heidelberg, Alemania

Cribado en todo el genoma de matrices celulares para identificar genes noveles implicados en la maquinaria del transporte intracelular. Imagen por cortesía del Dr. R. Peperkok, EMBL, Heidelberg, Alemania.

Ensayo de infección por chlamydia trachomatis. Imagen por cortesía del Dr. S. Hess, Max Planck Institute (MPI) for Infection Biology, Berlín, Alemania.

Segmentación de células binucleadas y recuento de micronúcleos. Imagen por cortesía del Departamento de toxicología in vitro, raunhofer Institute Toxicology and Experimental Medicine (ITEM), Hannover, Alemania

Opciones flexibles del módulo

La solución scanR no sólo satisface los requisitos específicos de velocidad, resistencia y fiabilidad de un sistema de cribado de alto contenido completamente automatizado, sino que también ofrece niveles incomparables de flexibilidad y adaptabilidad con numerosas opciones de expansión. Esto permite que el sistema scanR cumpla las especificaciones de una gama más amplia de aplicaciones y presupuestos. Es posible agregar módulos con las siguientes capacidades a su sistema:

Microscopía de autoaprendizaje basada en la tecnología de aprendizaje profundo (Deep Learning)
Medición de parámetros cinéticos
Deconvolución en 3D a alta velocidad
Autoenfoque por instrumentación de láser infrarrojo (IR) (basado en IX83 ZDC)
Y, mucho más.

Póngase en contacto con los especialistas de aplicaciones para personalizar su sistema a sus aplicaciones

Deconvolución de alta velocidad

Deconvolución TruSight de alta velocidad

Comparación de campo amplio, deconvolución en 2D y deconvolución en 3D para detectar las estructuras finas de las muestras sin comprometer el rendimiento.

Tecnología TruFocus con autoenfoque por instrumentación de láser infrarrojo (IR)

El modo AF continuo mantiene el plano de observación perfectamente enfocado, incluso durante la adición de reactivos o el cambio térmico de la sala.

Microscopía de autoaprendizaje basada en la tecnología de aprendizaje profundo (Deep Learning)

Microscopía de autoaprendizaje con tecnología de aprendizaje profundo (Deep Learning)

De izquierda a derecha: Predicción de IA de posiciones de núcleos (azul), marcadores 2B de histona de proteína fluorescente verde (GFP) mostrando el núcleo (verde) e imagen de transmisión de campo claro sin editar (gris).

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Tecnologías aplicadas

Control por puertas y clasificación Los potentes conceptos analíticos de datos aplicados en la citometría se adaptan para satisfacer la demanda del análisis de los conjuntos de datos de grandes imágenes. Los datos de imágenes multidimensionales se muestran en diagramas de dispersión bidimensionales o histogramas unidimensionales; las poblaciones de datos agrupados de interés pueden seleccionarse usando herramientas gráficas. Las puertas de distintos diagramas pueden combinarse con operadores booleanos para crear esquemas de clasificación muy complejos.	Un enfoque controlado por puertas de nivel jerárquico permite seleccionar de forma intuitiva partes de datos que pueden ser visualizadas en galerías.

Control por puertas y clasificación

Los potentes conceptos analíticos de datos aplicados en la citometría se adaptan para satisfacer la demanda del análisis de los conjuntos de datos de grandes imágenes.
Los datos de imágenes multidimensionales se muestran en diagramas de dispersión bidimensionales o histogramas unidimensionales; las poblaciones de datos agrupados de interés pueden seleccionarse usando herramientas gráficas.
Las puertas de distintos diagramas pueden combinarse con operadores booleanos para crear esquemas de clasificación muy complejos.

Un enfoque controlado por puertas de nivel jerárquico permite seleccionar de forma intuitiva partes de datos que pueden ser visualizadas en galerías.

Inicio rápido

Los modelos de redes neuronales preformadas incluidas le permiten empezar a usar la IA de forma rápida. Los modelos preformados le permiten empezar a detectar el núcleo y las células en la mayoría de condiciones estándar. Incluso las células confluentes y los núcleos densos pueden distinguirse con fiabilidad.

Las medidas de control y validación se encuentran integradas al sistema para poder garantizar la precisión y la fiabilidad de los resultados de análisis por la inteligencia artificial (IA).

Segmentación precisa de objetos: datos sin procesar (izq.), segmentación umbral estándar (centro), segmentación de instancia TruAI (dcha.). La segmentación de instancias separa de forma fiable los objetos difíciles de distinguir que están situados muy cerca entre sí, tales como células o núcleos en colonias o tejidos.

Detalle de imagen de captura de pantalla después de la adquisición de datos mediante scanR demostrando la detección y la separación de etiquetas. Cortesía del Dr. R. Peperkok, EMBL, Heidelberg, Alemania.	Detección y análisis de objetos Los potentes módulos de detección de objetos segmentan núcleos, células u otras estructuras. Escoja los diversos algoritmos de detección y adáptelos a los objetos de interés. En función de los resultados de la segmentación, es posible seleccionar las características que se han de extraer de una lista de más de 100 parámetros de objetos. Facilita una amplia gama de ensayos basados en células.

Detalle en imagen capturada después de la adquisición de datos mediante el sistema scanR que demuestra la detección y la separación del marcado. Cortesía del Dr. R. Peperkok, EMBL, Heidelberg, Alemania.

Detalle de imagen de captura de pantalla después de la adquisición de datos mediante scanR demostrando la detección y la separación de etiquetas. Cortesía del Dr. R. Peperkok, EMBL, Heidelberg, Alemania.

Detección y análisis de objetos

Los potentes módulos de detección de objetos segmentan núcleos, células u otras estructuras.
Escoja los diversos algoritmos de detección y adáptelos a los objetos de interés.
En función de los resultados de la segmentación, es posible seleccionar las características que se han de extraer de una lista de más de 100 parámetros de objetos.
Facilita una amplia gama de ensayos basados en células.

Control de calidad instantáneo Las imágenes y los objetos están vinculados recíprocamente a sus puntos de datos respectivos: Por ejemplo, al hacer clic en un punto de datos, la imagen correspondiente se carga en la ventana de visualización y se resalta el objeto en cuestión. Por otro lado, al hacer clic en un objeto dentro de la ventana de visualización de la imagen, los puntos de datos relacionados son resaltados en las representaciones de dispersión e histogramas. Cree una vista de galería de todas las imágenes o la población de datos limitada para realizar una comparación visual directa de conjuntos de imágenes más grandes con información relevante.	Los resultados se visualizan en mapas térmicos o se exportan a tablas. Puede visualizar fácilmente un resumen de todos los pocillos llenos.

Control de calidad instantáneo

Las imágenes y los objetos están vinculados recíprocamente a sus puntos de datos respectivos:

Por ejemplo, al hacer clic en un punto de datos, la imagen correspondiente se carga en la ventana de visualización y se resalta el objeto en cuestión.
Por otro lado, al hacer clic en un objeto dentro de la ventana de visualización de la imagen, los puntos de datos relacionados son resaltados en las representaciones de dispersión e histogramas.

Cree una vista de galería de todas las imágenes o la población de datos limitada para realizar una comparación visual directa de conjuntos de imágenes más grandes con información relevante.

Los resultados se visualizan en mapas térmicos o se exportan a tablas. Puede visualizar un resumen de todos los pocillos llenos de forma sencilla.

Los resultados se visualizan en mapas térmicos o se exportan a tablas. Puede visualizar fácilmente un resumen de todos los pocillos llenos.

Videos asociados	Adquisición multinivel Después de un escaneo preliminar inicial, el software de análisis scanR puede identificar todos los objetos potenciales de interés. En un proceso de trabajo automatizado, los resultados son usados para escanear los objetos de interés de forma selectiva en una segunda pantalla específica.

Adquisición multinivel

Después de un escaneo preliminar inicial, el software de análisis scanR puede identificar todos los objetos potenciales de interés. En un proceso de trabajo automatizado, los resultados son usados para escanear los objetos de interés de forma selectiva en una segunda pantalla específica.

Medición de los parámetros cinéticos con el módulo cinético Clasifique células vivas, núcleos y otros objetos en función de sus propiedades de variación temporal. Evalúe las curvas de control basándose en valores (parámetros estáticos principales, como la intensidad, el área, la proporción, el factor de forma, etc.) medidos a lo largo del tiempo. Evalúe y analice parámetros estáticos, como la intensidad o el índice de marcadores de fluorescencia, posición, tamaño o forma en el tiempo. Las curvas se condensan en valores característicos únicos (parámetros cinéticos). Represente los parámetros cinéticos en histogramas en 1D o 2D y limite las poblaciones basándose en sus propiedades específicas de variación temporal.	Células de hES expresando un biosensor de FUCC (CA). Cortesía de la Dra. Silvia Santos, The Francis Crick Institute, Londres, Reino Unido.

Medición de los parámetros cinéticos con el módulo cinético

Clasifique células vivas, núcleos y otros objetos en función de sus propiedades de variación temporal.
Evalúe las curvas de control basándose en valores (parámetros estáticos principales, como la intensidad, el área, la proporción, el factor de forma, etc.) medidos a lo largo del tiempo.
Evalúe y analice parámetros estáticos, como la intensidad o el índice de marcadores de fluorescencia, posición, tamaño o forma en el tiempo.
Las curvas se condensan en valores característicos únicos (parámetros cinéticos).
Represente los parámetros cinéticos en histogramas en 1D o 2D y limite las poblaciones basándose en sus propiedades específicas de variación temporal.

Células de hES expresando un biosensor de FUCC (CA). Cortesía de la Dra. Silvia Santos, The Francis Crick Institute, Londres, Reino Unido.

	Combinación de un procesamiento de imágenes de alto nivel con análisis de alto contenido Ejecute el software de procesamiento de imágenes de células vivas cellSens en el mismo sistema que la solución scanR a fin de usar la misma configuración en el análisis y el procesamiento de imágenes de alto nivel de forma simultánea. Obtenga detalles de imagen de alta calidad a partir de las aplicaciones de cribado más exigente mediante el uso de algoritmos de deconvolución iterativa forzada en 2D y 3D. Los algoritmos rápidos, y fáciles de usar, eliminan la borrosidad y la imagen de fondo desenfocada para revelar los detalles estructurales esenciales. Útil para análisis profundos que requieren detalles estructurales en alta resolución.

Una misma configuración en dos sistemas

Combinación de un procesamiento de imágenes de alto nivel con análisis de alto contenido

Ejecute el software de procesamiento de imágenes de células vivas cellSens en el mismo sistema que la solución scanR a fin de usar la misma configuración en el análisis y el procesamiento de imágenes de alto nivel de forma simultánea.
Obtenga detalles de imagen de alta calidad a partir de las aplicaciones de cribado más exigente mediante el uso de algoritmos de deconvolución iterativa forzada en 2D y 3D.
Los algoritmos rápidos, y fáciles de usar, eliminan la borrosidad y la imagen de fondo desenfocada para revelar los detalles estructurales esenciales.
Útil para análisis profundos que requieren detalles estructurales en alta resolución.

Microscopía de autoaprendizaje

La microscopía de autoaprendizaje abre nuevos horizontes en el análisis de alto contenido. Las aplicaciones van desde las tareas de segmentación y clasificación de imágenes —que antes eran imposibles—, hasta el análisis cuantitativo de niveles de señal extremadamente bajos, la simplificación de los protocolos de tinción, el análisis sin marcado y mucho más.

Microscopía de autoaprendizaje

Ejemplo de flujo de trabajo usando la microscopía de autoaprendizaje con el fin de generar un modelo de IA para el análisis sin marcado de imágenes complejas de campo claro. El núcleo celular de las células de HeLa están marcadas con GFP para la fase de formación, con el objetivo de mostrar al sistema cómo analizar las imágenes de campo claro.

Consulte el informe técnico

Una nueva forma de pensar

Ejemplo de aplicación: Segmentación sólida de los núcleos celulares bajo diferentes niveles de señal, lo que permite una reducción radical de la exposición a la luz para el análisis cuantitativo.

El usuario posee un completo control sobre el diseño del experimento de formación.

Durante la fase de formación pueden cubrirse muchas condiciones de análisis desafiantes.

El protocolo analítico aprendido por la inteligencia artificial puede ser validado de forma exhaustiva y fácil a través de la interfaz de análisis y exploración de datos exclusiva del software.

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Especificaciones

Estativo del microscopio	Microscopio invertido IX83 de Olympus con uno o dos bancos. Platina motorizada Märzhäuser SCAN IM 120 × 80 dedicada al microscopio IX83 de Olympus.
Opciones LED de fluorescencia	Lumencor SpectraX: Seis canales LED independientes CoolLED pE-300ultra: Tres canales LED independientes Filtros de paso de banda optimizados para la aplicación Vida útil > 20 000 horas
Opciones de iluminación de luz transmitida	Iluminación de luz transmitida solo para la inspección visual (sin cribado de iluminación transmitida). Iluminación de luz transmitida para cribado e inspección visual, incluyendo el obturador rápido (cribado de luz transmitida soportado) Contraste de interferencia diferencial (DIC) opcional o contraste de fase
Control de hardware y sincronización de sistema (opcional)	Controlador en tiempo real con CPU adicional, independiente del sistema operativo de procesamiento de imágenes del PC. Resolución temporal: 1 ms Precisión de la temporización: < 0,01 ms Adquisición multitarea, sincronizada por hardware (control de iluminación, filtros de emisión, obturadores, etc.) Control de cámara preciso por accionador externo
Opciones de cámara	ORCA-Flash 4.0, V3, de Hamamatsu —cámara de alta sensibilidad con tecnología sCMOS de color enfriado (cooled) y gran chip sensor de 18,8 mm (0,74 pulg.). ORCA-Flash 4.0 LT de Hamamatsu —cámara económica con tecnología sCMOS y gran chip sensor de 18,8 mm (0,74 pulg.). ORCA-Fusion de Hamamatsu —cámara con tecnología sCMOS y gran chip de sensor de 21,2 mm (0,83 pulg). ORCA-Fusion de Hamamatsu —cámara con tecnología sCMOS de ruido ultra bajo y gran chip sensor de 21,2 mm (0,83 pulg.).
Opciones de objetivo (compatible con los objetivos X Line de Olympus)	Objetivos para sustratos «finos» (de 0,1 mm a 0,2 mm [de 0,004 pulg. a 0,008 pulg.]), cubreobjetos y placas de fondo de vidrio (2X, 4X, 10X, 20X, 40X, 60X, 100X). Objetivos para sustratos «gruesos» (~1 mm [0,04 pulg.]), placas de fondo de plástico y diapositivas (2X, 4X, 10X, 20X, 40X, 60X, 100X). Objetivos de contraste de fase para sustratos «finos» (de 0,1 mm a 0,2 mm [de 0,004 pulg. a 0,008 pulg.]), cubiertas y placas de fondo de vidrio (10X, 20X, 40X). Objetivos de contraste de fase para sustratos «gruesos» (~1 mm [0,04 pulg.]), cubiertas y placas de fondo de vidrio (10X, 20X, 40X).
Conjuntos de filtros	Conjuntos de filtros unibanda (especificaciones según pedido) Conjuntos de filtros multibanda (especificaciones según pedido)
Sistema scanR Software	Dos módulos de software independientes: software de adquisición scanR y software de análisis scanR. Proceso de corrección de sombreado para compensar el sombreado y optimizar la homogeneidad de la intensidad espacial durante y después de la adquisición. Los módulos de software pueden instalarse en la misma estación de trabajo u otra diferente (Windows 10 de 64 bits).
Adquisición scanR (scanR Acquisition) Software	Configuración orientada al flujo de trabajo e interfaz de usuario Procedimientos de autoenfoque de software variables y potentes que pueden ser combinados con una función opcional de autoenfoque de hardware de láser IR, autoenfoque grueso y fino de 2 pasos, autoenfoque basado en objetos o autoenfoque basado en imágenes. Administrador de placas con formatos predefinidos (portaobjetos, placas multipocillos) e interfaz de edición para crear y editar formatos personalizados (matrices marcadas) Corrección del sombreado para compensar el sombreado y optimizar la homogeneidad de la intensidad espacial. Cribado en intervalos, cribado con apilamiento en Z, cribado multicolor (número ilimitado de canales de adquisición). Ofrece asistencia en líneas de preparación de muestras automatizadas; por ejemplo, interfaces programables para manipulación de líquidos
Análisis scanR (scanR Analysis) Software	Análisis automático de datos e imágenes para ensayos estándar y desarrollo de ensayos Análisis multinúcleo en línea y fuera de línea. Procesamiento de imágenes, análisis de imágenes, detección de partículas, selección y cálculo de parámetros. Exploración, análisis, control por puertas y clasificación de datos citométricos. Concepto de control por puertas potente y flexible con detección automática de partes (población). Enlace directo entre puntos de datos, objetos e imágenes. Flujos de trabajo basados en ensayos y funciones de desarrollo para ensayos científicos
PC	PC de procesamiento de imágenes (de última generación) con sistema operativo Windows 10 de 64 bits
Opciones adicionales	Solución de aprendizaje profundo [Deep-Learning] por inteligencia artificial scanR. Módulo de análisis cinético en intervalos: enfoque citométrico único para analizar y comprender mejor la dinámica de las células vivas. Módulo de deconvolución 3D (requiere sistema operativo de 64 bits). Opción de unidad confocal CSU-W1 de Yokogawa con una o dos cámaras Adquisición simultánea por dos cámaras Función de autoenfoque por instrumentación de láser infrarrojo (IR) basada en el ZDC de la serie de microscopios IX83 de Olympus Robot de carga de placa Modificador de magnificación codificado IX3-CAS Rueda de filtro de emisión rápida para procesamiento de imágenes en configuración «Sedat» Estación de trabajo de análisis scanR adicional Segunda licencia para el software de análisis scanR Visor de análisis scanR
Dos sistemas en una configuración	Es posible combinarlo con el software de procesamiento de imágenes vivas cellSens para obtener la plena versatilidad de un sistema de procesamiento de imágenes de primer nivel.