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Descripción
![]() | Estación modular para cribado de alto contenido dedicada a las ciencias de la vidaLa plataforma modular microscópica de procesamiento de imágenes scanR, permite la adquisición de imágenes y el análisis de datos de muestras biológicas de forma totalmente automatizada gracias a la tecnología de aprendizaje profundo (Deep Learning). |
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Hardware (instrumentación) flexible y modularLa estación de cribado scanR combina la modularidad y la flexibilidad de una configuración microscópica dotada de las capacidades necesarias de automatización, rapidez y rendimiento para el cribado de alto contenido. El diseño modular, pensado para la ejecución de ensayos estándar y el desarrollo de estos mismos, hace que la estación scanR se adapte a las aplicaciones de laboratorio de I+D o entornos multiusuario. |
Sistema confocal de disco giratorio
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Sistema de carga robótico
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Sistema de incubación
| Sistema TIRF y FRAP (con el software cellSens)
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Videos asociados | Software completoEl diseño flexible del sistema permite cumplir con los requisitos del procesamiento de imágenes cuantitativo y el análisis de imágenes en los ámbitos de biología celular, biología molecular, biología de sistemas e investigación médica.
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Cobertura de los requisitos de varios ensayosEl sistema scanR destaca en las aplicaciones de descubrimiento de fármacos/medicamentos, ya que muestra los efectos bioquímicos de los compuestos a nivel celular y los cambios inducidos por fármacos en los niveles de expresión genética. Esta solución puede medir apoptosis, micronúcleos o fragmentación del ADN (ensayos cometa) y cubre una amplia gama de aplicaciones de cribado:
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Cribado en todo el genoma de matrices celulares para identificar genes noveles implicados en la maquinaria del transporte intracelular. Imagen por cortesía del Dr. R. Peperkok, EMBL, Heidelberg, Alemania. | Ensayo de infección por chlamydia trachomatis. Imagen por cortesía del Dr. S. Hess, Max Planck Institute (MPI) for Infection Biology, Berlín, Alemania. | Segmentación de células binucleadas y recuento de micronúcleos. Imagen por cortesía del Departamento de toxicología in vitro, raunhofer Institute Toxicology and Experimental Medicine (ITEM), Hannover, Alemania. |
Opciones flexibles del móduloLa solución scanR no sólo satisface los requisitos específicos de velocidad, resistencia y fiabilidad de un sistema de cribado de alto contenido completamente automatizado, sino que también ofrece niveles incomparables de flexibilidad y adaptabilidad con numerosas opciones de expansión. Esto permite que el sistema scanR cumpla las especificaciones de una gama más amplia de aplicaciones y presupuestos. Es posible agregar módulos con las siguientes capacidades a su sistema:
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Tecnologías aplicadas
Control por puertas y clasificación
| Un enfoque controlado por puertas de nivel jerárquico permite seleccionar de forma intuitiva partes de datos que pueden ser visualizadas en galerías. |
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Inicio rápidoLos modelos de redes neuronales preformadas incluidas le permiten empezar a usar la IA de forma rápida. Los modelos preformados le permiten empezar a detectar el núcleo y las células en la mayoría de condiciones estándar. Incluso las células confluentes y los núcleos densos pueden distinguirse con fiabilidad. Las medidas de control y validación se encuentran integradas al sistema para poder garantizar la precisión y la fiabilidad de los resultados de análisis por la inteligencia artificial (IA). |
Segmentación precisa de objetos: datos sin procesar (izq.), segmentación umbral estándar (centro), segmentación de instancia TruAI (dcha.). La segmentación de instancias separa de forma fiable los objetos difíciles de distinguir que están situados muy cerca entre sí, tales como células o núcleos en colonias o tejidos. |
Detalle de imagen de captura de pantalla después de la adquisición de datos mediante scanR demostrando la detección y la separación de etiquetas. Cortesía del Dr. R. Peperkok, EMBL, Heidelberg, Alemania. | Detección y análisis de objetos
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Control de calidad instantáneoLas imágenes y los objetos están vinculados recíprocamente a sus puntos de datos respectivos:
Cree una vista de galería de todas las imágenes o la población de datos limitada para realizar una comparación visual directa de conjuntos de imágenes más grandes con información relevante. | Los resultados se visualizan en mapas térmicos o se exportan a tablas. Puede visualizar fácilmente un resumen de todos los pocillos llenos. |
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Videos asociados | Adquisición multinivelDespués de un escaneo preliminar inicial, el software de análisis scanR puede identificar todos los objetos potenciales de interés. En un proceso de trabajo automatizado, los resultados son usados para escanear los objetos de interés de forma selectiva en una segunda pantalla específica. |
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Medición de los parámetros cinéticos con el módulo cinético
| Células de hES expresando un biosensor de FUCC (CA). Cortesía de la Dra. Silvia Santos, The Francis Crick Institute, Londres, Reino Unido. |
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Combinación de un procesamiento de imágenes de alto nivel con análisis de alto contenido
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Microscopía de autoaprendizajeLa microscopía de autoaprendizaje abre nuevos horizontes en el análisis de alto contenido. Las aplicaciones van desde las tareas de segmentación y clasificación de imágenes —que antes eran imposibles—, hasta el análisis cuantitativo de niveles de señal extremadamente bajos, la simplificación de los protocolos de tinción, el análisis sin marcado y mucho más. |
Ejemplo de flujo de trabajo usando la microscopía de autoaprendizaje con el fin de generar un modelo de IA para el análisis sin marcado de imágenes complejas de campo claro. El núcleo celular de las células de HeLa están marcadas con GFP para la fase de formación, con el objetivo de mostrar al sistema cómo analizar las imágenes de campo claro. | Ejemplo de aplicación: Segmentación sólida de los núcleos celulares bajo diferentes niveles de señal, lo que permite una reducción radical de la exposición a la luz para el análisis cuantitativo. |
Videos asociadosEl usuario posee un completo control sobre el diseño del experimento de formación. | Videos asociadosDurante la fase de formación pueden cubrirse muchas condiciones de análisis desafiantes. | Videos asociadosEl protocolo analítico aprendido por la inteligencia artificial puede ser validado de forma exhaustiva y fácil a través de la interfaz de análisis y exploración de datos exclusiva del software. |
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Especificaciones
Estativo del microscopio |
Microscopio invertido IX83 de Olympus con uno o dos bancos.
Platina motorizada Märzhäuser SCAN IM 120 × 80 dedicada al microscopio IX83 de Olympus. |
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Opciones LED de fluorescencia |
Lumencor SpectraX: Seis canales LED independientes
CoolLED pE-300ultra: Tres canales LED independientes Filtros de paso de banda optimizados para la aplicación Vida útil > 20 000 horas |
Opciones de iluminación de luz transmitida |
Iluminación de luz transmitida solo para la inspección visual (sin cribado de iluminación transmitida).
Iluminación de luz transmitida para cribado e inspección visual, incluyendo el obturador rápido (cribado de luz transmitida soportado) Contraste de interferencia diferencial (DIC) opcional o contraste de fase |
Control de hardware y sincronización de sistema (opcional) |
Controlador en tiempo real con CPU adicional, independiente del sistema operativo de procesamiento de imágenes del PC.
Resolución temporal: 1 ms Precisión de la temporización: < 0,01 ms Adquisición multitarea, sincronizada por hardware (control de iluminación, filtros de emisión, obturadores, etc.) Control de cámara preciso por accionador externo |
Opciones de cámara |
ORCA-Flash 4.0, V3, de Hamamatsu —cámara de alta sensibilidad con tecnología sCMOS de color enfriado (cooled) y gran chip sensor de 18,8 mm (0,74 pulg.).
ORCA-Flash 4.0 LT de Hamamatsu —cámara económica con tecnología sCMOS y gran chip sensor de 18,8 mm (0,74 pulg.). ORCA-Fusion de Hamamatsu —cámara con tecnología sCMOS y gran chip de sensor de 21,2 mm (0,83 pulg). ORCA-Fusion de Hamamatsu —cámara con tecnología sCMOS de ruido ultra bajo y gran chip sensor de 21,2 mm (0,83 pulg.). |
Opciones de objetivo
(compatible con los objetivos X Line de Olympus) |
Objetivos para sustratos «finos» (de 0,1 mm a 0,2 mm [de 0,004 pulg. a 0,008 pulg.]), cubreobjetos y placas de fondo de vidrio (2X, 4X, 10X, 20X, 40X, 60X, 100X).
Objetivos para sustratos «gruesos» (~1 mm [0,04 pulg.]), placas de fondo de plástico y diapositivas (2X, 4X, 10X, 20X, 40X, 60X, 100X). Objetivos de contraste de fase para sustratos «finos» (de 0,1 mm a 0,2 mm [de 0,004 pulg. a 0,008 pulg.]), cubiertas y placas de fondo de vidrio (10X, 20X, 40X). Objetivos de contraste de fase para sustratos «gruesos» (~1 mm [0,04 pulg.]), cubiertas y placas de fondo de vidrio (10X, 20X, 40X). |
Conjuntos de filtros |
Conjuntos de filtros unibanda (especificaciones según pedido)
Conjuntos de filtros multibanda (especificaciones según pedido) |
Sistema scanR
Software |
Dos módulos de software independientes: software de adquisición scanR y software de análisis scanR.
Proceso de corrección de sombreado para compensar el sombreado y optimizar la homogeneidad de la intensidad espacial durante y después de la adquisición. Los módulos de software pueden instalarse en la misma estación de trabajo u otra diferente (Windows 10 de 64 bits). |
Adquisición scanR (scanR Acquisition)
Software |
Configuración orientada al flujo de trabajo e interfaz de usuario
Procedimientos de autoenfoque de software variables y potentes que pueden ser combinados con una función opcional de autoenfoque de hardware de láser IR, autoenfoque grueso y fino de 2 pasos, autoenfoque basado en objetos o autoenfoque basado en imágenes. Administrador de placas con formatos predefinidos (portaobjetos, placas multipocillos) e interfaz de edición para crear y editar formatos personalizados (matrices marcadas) Corrección del sombreado para compensar el sombreado y optimizar la homogeneidad de la intensidad espacial. Cribado en intervalos, cribado con apilamiento en Z, cribado multicolor (número ilimitado de canales de adquisición). Ofrece asistencia en líneas de preparación de muestras automatizadas; por ejemplo, interfaces programables para manipulación de líquidos |
Análisis scanR (scanR Analysis)
Software |
Análisis automático de datos e imágenes para ensayos estándar y desarrollo de ensayos
Análisis multinúcleo en línea y fuera de línea. Procesamiento de imágenes, análisis de imágenes, detección de partículas, selección y cálculo de parámetros. Exploración, análisis, control por puertas y clasificación de datos citométricos. Concepto de control por puertas potente y flexible con detección automática de partes (población). Enlace directo entre puntos de datos, objetos e imágenes. Flujos de trabajo basados en ensayos y funciones de desarrollo para ensayos científicos |
PC | PC de procesamiento de imágenes (de última generación) con sistema operativo Windows 10 de 64 bits |
Opciones adicionales |
Solución de aprendizaje profundo [Deep-Learning] por inteligencia artificial scanR.
Módulo de análisis cinético en intervalos: enfoque citométrico único para analizar y comprender mejor la dinámica de las células vivas. Módulo de deconvolución 3D (requiere sistema operativo de 64 bits). Opción de unidad confocal CSU-W1 de Yokogawa con una o dos cámaras Adquisición simultánea por dos cámaras Función de autoenfoque por instrumentación de láser infrarrojo (IR) basada en el ZDC de la serie de microscopios IX83 de Olympus Robot de carga de placa Modificador de magnificación codificado IX3-CAS Rueda de filtro de emisión rápida para procesamiento de imágenes en configuración «Sedat» Estación de trabajo de análisis scanR adicional Segunda licencia para el software de análisis scanR Visor de análisis scanR |
Dos sistemas en una configuración | Es posible combinarlo con el software de procesamiento de imágenes vivas cellSens para obtener la plena versatilidad de un sistema de procesamiento de imágenes de primer nivel. |