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如何在cellSens Dimension软件中对图像指定区域的目标对象进行计数

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在cellSens Dimension图像软件中,通过计测工具将显微镜图像中的蓝色细胞核区域标记为感兴趣区(ROI),并对该区域内的红色和绿色点状信号进行计数测量

利用cellSens Dimension软件选配的计测工具,即可轻松对图像中的目标对象进行计数。但是如果要对不同区域内的目标对象进行计数呢?不用担心,一切尽在我们的考虑之中!

这里使用的示例图像包含三个荧光通道:蓝色,绿色和红色。我们的目标是对每个蓝色细胞核区域内的绿色和红色点状信号进行计数。

专家提示:在cellSens Dimension软件中对指定区域内的目标对象进行计数之前,您首先应在选项>计测>测量菜单中定义您所要进行的测量。点击选定分类测量,并将所需的测量添加到下方的列表中。每种测量均有简短的图文说明。

定义感兴趣区(ROI)

首先,您需要准确选取图像中的蓝色细胞核区域,并将其设为感兴趣区:

  1. 选维器工具窗口中,仅选择蓝色细胞核通道。
  2. 切换到计测工具窗口,手动设置蓝色通道的阈值,准确筛选出图像中的细胞核区域 。
  3. 点击计测,并在计测结果工具窗口中查看结果。
  4. 在对象测量选项卡中,按区域面积大小对计测结果进行筛选,删除所有非细胞核的结果区域。
  5. 选定筛选后检测到的所有对象,并在必要时对相连的细胞核进行拆分。
  6. 拆分后检测对象数将会增加。再次选定图像中检测到的所有对象。
  7. 在图像中点击右键,选择从选定对象创建感兴趣区
  8. 计测结果窗口中删除检测到的所有对象。因为现在蓝色细胞核区域已被定义为感兴趣区,无需作为检测对象存在。

多通道检测目标对象

接下来,我们将对蓝色细胞核区域内的绿色和红色点状信号进行计数。

操作步骤如下:

  1. 选维器工具窗口中选择红色和绿色通道
  2. 手动设置两个通道的阈值。
  3. 点击计测按钮旁边的箭头,并选择在感兴趣区上计测
  4. 在计测结果工具窗口中,切换到分类直方图选项卡。
  5. 测量下拉菜单中,选择对象数 选项。
  6. 分组依据下拉菜单中,选择感兴趣区选项。现在,您就可以得到显示每个细胞核区域内红色和绿色信号点数量的直方图!

就这么简单!我们希望这些技巧对您有所帮助。

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生命科学显微镜产品经理

Lauren Alvarenga是奥林巴斯美洲公司科学解决方案部门研究成像的产品经理。她目前负责成像软件以及倒置和超分辨率显微镜。她拥有罗彻斯特理工学院的生物医学摄影通信理学学士学位。

2021年3月30日
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