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EVIDENT Workflow-Lösungen für effizientere Wissenschaft

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Frau vor einem Mikroskop von Olympus, die eine Probe auf einem Computermonitor betrachtet

Mit einer über 100-jährigen Erfahrung in der Entwicklung von Optiken und dem in der Zusammenarbeit mit Wissenschaftlern erlangten Fachwissen möchten wir die Arbeitsabläufe bei der wissenschaftlichen Bildgebung mit hochmodernen Lösungen unterstützen. Wir sind stets auf der Suche nach fachlich fundierten Lösungen für experimentelle Problemstellungen. Zu Demonstrationszwecken werden hier eine Fallstudie, eine Anwendung und vier Workflow-Lösungen vorgestellt, die die Effizienz von Experimenten verbessern: von der Zellkultur bis zur Bildgebung und Bildanalyse. 

Infografik: EVIDENT Workflow-Lösungen machen Forschung effizienter

Fallstudie: Standardisierung von Zellvorbereitungsschritten für effizientere Folgeexperimente

Bei der Durchführung von Experimenten zur Induktion der Differenzierung von Stammzellen wird die Effizienz in jedem der folgenden vier Schritte mit unseren Lösungen optimiert:

  1. Zellkulturen: Die quantitative Bewertung der Zellkulturbedingungen mit dem CM20 Inkubationsüberwachungssystem erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Zellen Gewebe bilden, wodurch nachfolgende Experimente effizienter werden. 
    In diesem Whitepaper erfahren Sie mehr darüber, wie Sie Ihren Zellkultur-Workflow erfolgreich effizienter gestalten.
  2. Vorversuche: In Vorversuchen mit differenzierten Zellen und Gewebeproben können Sie mit dem APEXVIEW APX100 Universalmikroskop in kürzerer Zeit und mit weniger Aufwand aussagekräftigere Daten erfassen.
    Im diesem Blogartikel erfahren Sie, wie das APX100 die Schritte vor dem Experiment vereinfacht..
  3. Datenerfassung: Bei diesem Schritt werden die funktionellen Merkmale der Probe mithilfe konfokaler Bildgebung beurteilt. Das konfokale Laser-Scanning-Mikroskop FLUOVIEW FV3000 ermöglicht die Aufnahme hochauflösender Bilder des Bereichs von Interesse, während die gesamte Probe erfasst wird. 
  4. Bildanalyse: Das TruAI Deep-Learning Modul der cellSens Bildgebungssoftware ermöglicht eine hochpräzise Bildanalyse.

Experiment mit Zellkulturen und Bildgebungsabläufen

Mit diesen vier Schritten können der Workflow verbessert und effizientere sowie effektivere Ergebnisse erzielt werden.

EVIDENT Workflow-Lösungen und konventionelle Methoden im Vergleich

Die folgende Tabelle enthält verschiedene Schritte in einem Zellkultur-Workflow, die üblicherweise manuell durchzuführen sind. Mithilfe von KI und modernen Tools können sie aber zeitsparend automatisiert werden. Auch wenn ein bestimmter Schritt für sich genommen vielleicht nicht besonders zeitaufwändig sein mag, muss er doch bei verschiedenen Zelltypen häufig viele Male wiederholt werden. Somit lässt sich langfristig erheblich Zeit sparen.

Die Vorteile betreffen aber nicht nur die Effizienz. Durch Faktoren, wie zum Beispiel eine Verringerung der Belastung der Zellen und die Vermeidung des Risikos menschlicher Fehler aufgrund manueller Schritte, verbessert sich außerdem die Qualität der Experimente.

Konventionelle Methoden EVIDENT Workflow-Lösungen
Zellkultur Überprüfung der Zellen Die Zellkultur muss jedes Mal aus dem Inkubator genommen werden. Es kann eine Fernüberprüfung durchgeführt werden, was die Entnahme von Zellkulturen aus dem Inkubator überflüssig macht.
Zellzählung und Messung der Dichte Mit Zellzählungsgeräten usw. Automatische Messung während der Überwachung
Zellkulturbedingungen Je nach Person verschieden Quantitativ
Vor dem Versuch Festlegung der Betrachtungsposition

Mit bloßem Auge und mit Mikroskop
(10 Sekunden bis Minuten)

Automatische Erkennung
(ungefähr 10 Sekunden)

Datenerfassung Bildgebung mehrerer Proben Eine Probe nach der anderen Automatische Bildgebung mehrerer Proben
Bildanalyse Erkennung bestimmter Proben Manuelle Lokalisierung einer bestimmten Probe Automatische Erkennung mittels KI

Anwendung: Vorhersage von Kernphänotypen mehrerer Klassen für Arzneimittelprüfungen mittels Deep Learning

In der Wirkstoffforschung können trainierte neuronale Netze (NN) eingesetzt werden, um die Vorhersage von Phänotypen zu beschleunigen. Mit dem konfokalen Laser-Scanning-Mikroskop FV3000 und der TruAI Deep Learning Technologie der cellSens Bildgebungssoftware ist es möglich, die Position von Zellkernen einzuschätzen und Zellkerne ohne Färbung zu segmentieren. Darauf aufbauend kann dann eine Methode zur Klassifizierung von Zellen in einem Schritt basierend auf Veränderungen des AR-Phänotyps entsprechend des Medikaments entwickelt werden. Diese Vorgehensweise reduziert den experimentellen Zeit- und Kostenaufwand und macht chemische Tests effizienter.

Training eines neuronalen KI-Netzes für die automatisierte Phänotypvorhersage

Mehr über die Anwendung erfahren
 

Für diese Workflow-Lösungen verwendete Produkte

Erfahren Sie mehr über die Produkte der hier erwähnten Workflow-Lösungen.

CM20 Inkubationsüberwachungssystem


Das CM20 System überwacht den Zustand der Zellkultur im Inkubator und misst automatisch die Anzahl Zellen und Kolonien, die Dichte und die Zellkonfluenz und zeichnet sie grafisch auf. 
Die Automatisierung dieser üblicherweise manuell durchgeführten Schritte verbessert die Effizienz des Zellkulturprozesses und die Qualität der Zellkultur durch Etablierung eines auf quantitativen Daten basierenden Workflows.

Erfahren Sie mehr über das CM20 System
 

Zellkulturen auf CM20 Inkubationsüberwachungssystemen

APEXVIEW APX100 Universalmikroskop 

Der Smart Sample Navigator des APX100 Systems erfasst ein Makrobild automatisch, und die integrierte KI erkennt die Probe auf dem Objektträger. Die einfache und intuitive Software des Systems und seine Makrobilderfassungsfunktion sorgen für einen reibungslosen Versuchsablauf und den unkomplizierten Erhalt aussagekräftiger Bilder.

Erfahren Sie mehr über das APX100 System
 

Einfach zu bedienendes Forschungsmikroskop

Konfokales FLUOVIEW FV3000 Laser-Scanning-Mikroskop

Die Erkennung des Bereichs von Interesse in Ihrer Probe kann viel Zeit kosten. Das FV3000 System vereinfacht die Erfassung zusammengefügter Bilder – ob in geringer Vergrößerung (1,25x oder 2x) oder starker Vergrößerung. Durch die Verbindung von Makrobildern mit geringer Vergrößerung mit hochauflösenden Mikrobildern ermöglicht das FV3000 System eine kontinuierliche Makro-zu-Mikro-Betrachtung und automatisiert diese auch für den Bediener.

Erfahren Sie mehr über das FV3000 System

Automatisierte Makro-zu-Mikro-Bildgebung

cellSens Bildanalysesoftware

Unsere cellSens Bildgebungssoftware erleichtert verschiedene Bildanalyseaufgaben, wie z. B. Leuchtdichteanalyse, Messung und Klassifizierung von Objekten sowie Tracking-Analyse von Bilddaten, die mit einem Mikroskop aufgenommen wurden. Der Einsatz des TruAI Deep Learning Moduls für die Objekterkennung ermöglicht die automatisierte Analyse von Bildern, die bisher manuell analysiert werden mussten, und somit effizientere und genauere Ergebnisse.

Erfahren Sie mehr über die cellSens Bildanalysesoftware
 

TruAI erkennt die Glomeruli-Merkmale (rechts)

Vorhersage der Glomeruli-Positionen auf einem Maus-Nierenschnitt mit TruAI (blau).
Fluoreszenzbild von Zellkernen (grün), Hellfeldbild mit Zellkernen nach Erfassung mit der TruAI Technologie (blau)

Fluoreszenzbild von Zellkernen (grün), Hellfeldbild mit Zellkernen nach Erfassung mit der TruAI Technologie (blau)

Grün: Die Erkennungsgenauigkeit ist aufgrund von Ungleichmäßigkeiten der GFP-Färbung niedrig.
Blau: Erkennung der Zellkerne mit hoher Genauigkeit trotz Kratzern und Staub am Kulturgefäß.

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Ein großer Schritt für die automatisierte Bilderfassung – Objektträgerscans mit der TruAI Deep-Learning Technologie

Assistant Manager, Life Science Research Solutions, Global Marketing

Atsuya Toda is an assistant manager for Global Life Science Marketing at Evident. He has more than fifteen years of experience in life science microscopy sales, sales planning, and marketing in Japan. In 2021, he moved to the Global Life Science Marketing team where he is the marketing representative for the APEXVIEW APX100 all-in-one microscope. He holds a Bachelor of Economics degree from Doshisha University, Japan.

15.12.2022
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