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Olympus Discovery Summit : une qualité d’image inégalée | 26 - 27 octobre 2021

Olympus Discovery Summit : une qualité d’image inégalée

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Programme

SGT CEST EDT Mardi 26 octobre 2021 Mercredi 27 octobre 2021

12 h - 12 h 50

6 h - 6 h 50

00 h - 00 h 50

The Use of Multiplexing in Microscopy for Better Understanding the Skin Immune System in the Context of the Tissue

Intervenant :
Alfonso J. Schmidt

Chercheur principal
Malaghan Institute of Medical Research
 

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Evolution of Scientific Digital Imaging Technologies and its Applications

Intervenant :
Guo Lin, Ph.D.

Responsable produits et applications
Olympus Singapour
 

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13 h - 13 h 50

7 h - 7 h 50

1 h - 01 h 50

Now You Have the Power to See More

Intervenante :
Sandrine Roy, Ph.D.

Responsable du développement commercial
Olympus Australie et Nouvelle-Zélande
 

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Hyperspectral and Brightfield Imaging Combined with Deep Learning Uncover Hidden Regularities of Colors and Patterns in Cells and Tissues

Intervenante :
Ewa Goldys, Ph.D.

Directrice adjointe
Australian Research Council Centre of Excellence in Nanoscale Biophotonics
 

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14 h - 14 h 50

8 h - 08 h 50

2 h - 02 h 50

A Live Demonstration of the SLIDEVIEW™ VS200 Research Slide Scanner

Intervenant :
Chunsong Yan

Responsable du développement commercial
Olympus Australie et Nouvelle-Zélande
Tong Wu, Ph.D.
Responsable du développement commercial
Olympus Australie et Nouvelle-Zélande
 

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A New Way of Thinking—Object Detection with Deep Learning

Intervenant :
Akira Saito

Directeur adjoint, marketing et applications
Olympus Singapour
 

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15 h - 15 h 50

9 h - 09 h 50

3 h - 03 h 50

Recent Advances in 3D Imaging and AI-Driven Data Analysis

Intervenant :
Seungil Kim, Ph.D.

Chercheur
Ellison Institute for Transformative Medicine at the University of Southern California
 

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Confocal Microscopy and Its Use for a Spaceflight Experiment

Intervenant :
RJC (Bob) McLean, Ph.D.

Professeur distingué
Texas State University
 

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16 h - 16 h 50

10 h - 10 h 50

4 h - 04 h 50

Deep Learning Approaches to Automated Phenotypic Profiling

Intervenant :
Jesse Chao, Ph.D.

Scientifique
Sunnybrook Research Institute
 

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Live Demo: SLIDEVIEW™ VS200 Research Slide Scanner

Intervenante :
Sara Quiñones Gonzalez

Responsable de produit
Olympus Soft Imaging Solutions
Wei Juan Wong
Spécialiste en applications
Olympus Soft Imaging Solutions
 

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17 h - 17 h 50

11 h - 11 h 50

5 h - 05 h 50

Accelerating Image Analysis with TruAI™ Deep Learning Technology

Intervenant :
Manoel Veiga, Ph.D.

Spécialiste en applications
Olympus Soft Imaging Solutions
 

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The Use of Multiplexing in Microscopy for Better Understanding the Skin Immune System in the Context of the Tissue

Intervenant :
Alfonso J. Schmidt

Chercheur principal
Malaghan Institute of Medical Research
 

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18 h - 18 h 50

12 h - 12 h 50

6 h - 06 h 50

Pause

19 h - 19 h 50

13 h - 13 h 50

7 h - 07 h 50

Metabolic Imaging in Langerhans Human Islets with MPE and FLIM

Intervenant :
Francesco Cardarelli

Professeur agrégé en physique appliquée
Scuola Normale Superiore de Pise
 

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In-Vivo Tracking of Harmonic Nanoparticles by Means of a TIGER Widefield Microscope

Intervenante :
Laura Vittadello, Ph.D.

Department of Physics and Center of Cellular Nanoanalytics
Université d’Osnabrück
 

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20 h - 20 h 50

14 h - 14 h 50

8 h - 08 h 50

Live Demo: IXplore™ SpinSR Confocal Super Resolution System

Intervenant :
Stefan Marawske

Spécialiste des ventes senior, systèmes de pointe pour les sciences de la vie
Olympus Europe
 

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Live Demo: FLUOVIEW™ FV3000 Confocal Laser Scanning Microscope

Intervenant :
Bülent Peker

Directeur marketing produit senior
Olympus Europe
 

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21 h - 21 h 50

15 h - 15 h 50

9 h - 09 h 50

Deconvolution of 3D Image Stacks

Intervenant :
Heiko Gäthje

Formateur senior
Olympus Europe
 

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Titre de la présentation à déterminer

Intervenant :
Ruben Portugues, Ph.D.

Institute of Neuroscience
Technical University of Munich
 

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22 h - 22 h 50

16 h - 16 h 50

10 h - 10 h 50

The Use of Multiplexing in Microscopy for Better Understanding the Skin Immune System in the Context of the Tissue

Intervenant :
Alfonso J. Schmidt

Chercheur principal
Malaghan Institute of Medical Research
 

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23 h - 23 h 50

17 h - 17 h 50

11 h - 11 h 50

Confocal Microscopy and Its Use for a Spaceflight Experiment

Intervenant :
RJC (Bob) McLean, Ph.D.

Professeur distingué
Texas State University
 

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Metabolic Imaging in Langerhans Human Islets with MPE and FLIM

Intervenant :
Francesco Cardarelli

Professeur agrégé en physique appliquée
Scuola Normale Superiore de Pise
 

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00 h - 00 h 50

18 h - 18 h 50

12 h - 12 h 50

Pause

1 h - 01 h 50

19 h - 19 h 50

13 h - 13 h 50

Accelerating Image Analysis with TruAI™ Deep Learning Technology

Intervenant :
Manoel Veiga, Ph.D.

Spécialiste en applications
Olympus Soft Imaging Solutions
 

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In-Vivo Tracking of Harmonic Nanoparticles by Means of a TIGER Widefield Microscope

Intervenante :
Laura Vittadello, Ph.D.

Department of Physics and Center of Cellular Nanoanalytics
Osnabrück University
 

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2 h - 02 h 50

20 h - 20 h 50

14 h - 14 h 50

Recent Advances in 3D Imaging and AI-Driven Data Analysis

Intervenant :
Seungil Kim, Ph.D.

Chercheur
Ellison Institute for Transformative Medicine, University of Southern California
 

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Deep Learning Approaches to Automated Phenotypic Profiling

Intervenant :
Jesse Chao, Ph.D.

Scientifique
Sunnybrook Research Institute
 

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3 h - 03 h 50

21 h - 21 h 50

15 h - 15 h 50

Live Demo: FLUOVIEW™ FV3000 Confocal Laser Scanning Microscope

Intervenant :
James Lopez, Ph.D.

Responsable national des applications
Olympus Life Science
 

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Intervenants

Alfonso J. Schmidt

Chercheur principal
Malaghan Institute of Medical Research

Sandrine Roy, Ph.D.

Responsable du développement commercial
Olympus Australie et Nouvelle-Zélande

Alfonso J. Schmidt

Biographie

Alfonso a travaillé pendant plus de dix ans au sein d’un laboratoire de ressources partagé et possède de vastes connaissances en histologie, microscopie de fluorescence et analyse des images. Il a consacré ses travaux à l’optimisation des capacités des équipements disponibles et à la création de protocoles techniques et de modules de formation à destination de la communauté scientifique. Actuellement, Alfonso supervise le service d’histologie et de bio-imagerie du Hugh Green Cytometry Centre (HGCC) du Malaghan Institute of Medical Research de Wellington en Nouvelle-Zélande.

Résumé

The Use of Multiplexing in Microscopy for Better Understanding the Skin Immune System in the Context of the Tissue

La peau constitue la première ligne de défense et la plus grande barrière du système immunitaire pour combattre les agents pathogènes. La caractérisation et l’identification précises des sous-types de cellules immunitaires, des structures tissulaires et de la répartition des cellules de la peau dans des conditions stables permettent de mieux comprendre les processus biologiques et les premières stratégies immunologiques mis en place par l’organisme en présence d’agents pathogènes. Lors de ce webinaire, nous verrons les différents aspects techniques impliqués dans le processus expérimental et explorerons les technologies d’imagerie complémentaires susceptibles de pouvoir nous aider à mieux comprendre le système immunitaire.

La présentation est divisée en trois parties. Tout d’abord, nous présenterons le Hugh Green Cytometry Centre et passerons en revue ses plateformes technologiques d’histologie et de bio-imagerie. Ensuite, nous parlerons du multiplexage et des points à considérer pour la conception et le développement d’un panel polychromatique efficace pour la microscopie. Enfin, nous révélerons les résultats préliminaires d’un projet de recherche conduit dans le cadre d’un programme diplômant de la Royal Microscopical Society. Le projet porte sur l’identification des types de cellules immunitaires dans des spécimens de peau entiers en lien avec les structures tissulaires (vaisseaux sanguins et réseau lymphatique). Il s’intéresse également à la distribution des cellules immunitaires dans les tissus comme première barrière de défense contre les agents pathogènes.

Sandrine Roy

Biographie

Le Dr Roy a obtenu une maîtrise en biochimie et microbiologie complétée en 2002 par un doctorat en biologie moléculaire et biologie cellulaire de l’University of Queensland en Australie. Elle est partie aux États-Unis où elle a occupé un poste de postdoctorante à la Washington University à Saint-Louis. Elle est ensuite rentrée en Australie où elle a continué sa formation postdoctorale.

Grâce à sa grande expérience en microscopie, elle a été nommée en 2009 directrice du service de microscopie du Diamantina Institute à l’University of Queensland. Plus tard, elle est devenue directrice du service de microscopie du Translational Research Institute de Brisbane, un poste qu’elle a occupé jusqu’en 2019.

Aujourd’hui, elle occupe le poste de responsable du développement commercial chez Olympus Australie, où son expérience et ses connaissances sont utilisées pour porter assistance aux clients basés en Australie et en Nouvelle-Zélande.

Résumé

Now You Have the Power to See More

Le scanner de lames numérique Olympus VS200 a reçu un bon accueil depuis son lancement en mars 2020. Grâce à une conception fiable, souple et personnalisable, ce système a été adopté par de nombreux secteurs spécialisés dans la recherche, la géologie, etc. Joignez-vous à nous pour en apprendre plus et voir des exemples d’échantillons numérisés grâce à ce nouveau système de la gamme de produits Olympus.


Chunsong Yan

Tong Wu, Ph.D.

Chunsong Yan

Biographie

Chunsong est responsable du développement commercial pour la division Sciences de la vie chez d’Olympus Australie et Nouvelle-Zélande. Il est actuellement responsable des systèmes confocaux, multiphotoniques, à feuillet de lumière et de numérisation de lames. Il a rejoint Olympus en 2003. Au cours de ces années, il a occupé différents postes en ayant toujours en tête d’apporter la meilleure solution Olympus à nos clients.

Résumé

A Live Demonstration of the SLIDEVIEW™ VS200 Research Slide Scanner

Description de la présentation : le scanner de lames pour la recherche Olympus SLIDEVIEW VS200 produit des images de lames virtuelles de haute qualité et permet de réaliser une analyse quantitative avancée des images. Ce système permet d’acquérir des données de lames virtuelles fiables en seulement deux clics. Hautement polyvalent, le scanner de lames SLIDEVIEW VS200 propose cinq méthodes d’observation et est compatible avec une large gamme de tailles d’échantillon, ce qui vous permet de l’utiliser pour de nombreuses applications. Son chargeur de lames automatique permet d’accueillir de nombreuses lames en verre, ce qui aide à améliorer le rendement.

Au cours de cette session, Tong Wu et Chunsong Yan effectueront une démonstration en direct de ce produit et vous présenteront certains de ses avantages et quelques-unes de ses fonctionnalités :

  1. Le mode Flexible Batch Scan (numérisation par lots flexible) qui permet d’utiliser différentes méthodes d’observation, telles que FL, BF, POL, DF et PH, pour chaque lame d’un lot.
  2. L’imagerie de fluorescence haute résolution avec un objectif à immersion dans l’huile et distributeur automatique d’huile.
  3. Le défloutage en direct des images permettant de rendre vos images plus contrastées et plus nettes pendant leur acquisition.
  4. La gestion des données avec la base de données NIS SQL qui vous permet de stocker, gérer et partager facilement vos données.

Tong Wu

Biographie

Tong Wu a rejoint Olympus en 2012 après avoir terminé son doctorat en Chine (State Key Laboratory of Fine Chemicals, DLUT). Aujourd’hui, Tong est responsable du développement commercial pour les microscopes de pointe chez Olympus Australie. Grâce à son expérience de recherche sur les fluorophores utilisés en bio-imagerie et en bio-marquage, Tong Wu a à cœur de s’impliquer dans les applications de recherche des clients.

Résumé

A Live Demonstration of the SLIDEVIEW™ VS200 Research Slide Scanner

Description de la présentation : le scanner de lames pour la recherche Olympus SLIDEVIEW VS200 produit des images de lames virtuelles de haute qualité et permet de réaliser une analyse quantitative des images. Ce système permet d’acquérir des données de lames virtuelles fiables en seulement deux clics. Hautement polyvalent, le scanner de lames SLIDEVIEW VS200 propose cinq méthodes d’observation et est compatible avec une large gamme de tailles d’échantillon, ce qui vous permet de l’utiliser pour de nombreuses applications. Son chargeur de lames automatique permet d’accueillir de nombreuses lames en verre, ce qui aide à améliorer le rendement.

Au cours de cette session, Tong Wu et Chunsong Yan effectueront une démonstration en direct de ce produit et vous présenteront certains de ses avantages et quelques-unes de ses fonctionnalités :

  1. Le mode Flexible Batch Scan (numérisation par lots flexible) qui permet d’utiliser différentes méthodes d’observation, telles que FL, BF, POL, DF et PH, pour chaque lame d’un lot.
  2. L’imagerie de fluorescence haute résolution avec un objectif à immersion dans l’huile et distributeur automatique d’huile.
  3. Le défloutage en direct des images permettant de rendre vos images plus contrastées et plus nettes pendant leur acquisition.
  4. La gestion des données avec la base de données NIS SQL qui vous permet de stocker, gérer et partager facilement vos données.

Seungil Kim, Ph.D.

Chercheur
Ellison Institute for Transformative Medicine, University of Southern California

Jesse Chao, Ph.D.

Scientifique
Sunnybrook Research Institute

Seungil Kim

Biographie

Seungil Kim, Ph.D., est membre du personnel scientifique et responsable de l’équipe de microscopie à L’Ellison Institute for Transformative Medicine à l’USC Le Dr Kim a obtenu sa licence et son master en Corée du Sud. Il a ensuite intégré la Washington University et a obtenu son doctorat en biologie du développement. Il a mené son travail de recherche postdoctoral au sein du département de biologie cellulaire et tissulaire de l’UCSF. Seungil a travaillé pendant plus de 10 ans sur différents modèles in vitro et in vivo et plusieurs techniques d’imagerie cellulaire de pointe. L’objectif de ses travaux de recherche actuels est de comprendre l’impact du microenvironnement tumoral sur la réponse aux médicaments en utilisant des organoïdes dérivés de patients comme système modèle. En outre, il met au point des méthodes d’imagerie automatisées à haut débit pour analyser de nouveaux composés médicamenteux dans le cancer colorectal.

Résumé

Recent Advances in 3D Imaging and AI-Driven Data Analysis

Cette présentation permettra de mettre en avant différentes techniques d’imagerie pour les modèles 3D, l’immunomarquage avec clarification des tissus, l’imagerie en temps réel des organoïdes ainsi que l’analyse des données conduites par IA pour l’imagerie et le criblage à haut contenu.

Jesse Chao

Biographie

Jesse a obtenu son doctorat en biologie cellulaire et génomique à l’Université de Colombie-Britannique (UBC). Il a ensuite poursuivi sa formation à l’University of California, San Diego. De retour à l’UBC, il s’est intéressé au développement d’approches d’apprentissage automatique pour l’évaluation des impacts physiologiques des variants génétiques associés aux cancers héréditaires. Pendant cette période, il a commencé à mettre au point des approches d’apprentissage profond pour le profilage automatique des phénotypes à partir des données d’imagerie à haut contenu.

Résumé

Deep Learning Approaches to Automated Phenotypic Profiling

La quantification des phénotypes cellulaires est essentielle pour toutes les études de biologie cellulaire. Toutefois, les techniques d’imagerie modernes peuvent facilement générer plus de données que ce que l’utilisateur moyen peut traiter. Au cours de cette présentation, je vous parlerai de deux approches d’apprentissage profond utilisées pour la création de pipelines d’analyse d’image : l’apprentissage semi-supervisé et l’apprentissage supervisé. Ces deux approches peuvent toutes deux être utilisées avec une plateforme de GPU cloud gratuite.


Manoel Veiga, Ph.D.

Spécialiste en applications
Olympus Soft Imaging Solutions

Francesco Cardarelli

Professeur agrégé en physique appliquée
Scuola Normale Superiore, Pise

Manoel Veiga

Biographie

Manoel Veiga a obtenu son doctorat en physicochimie à l’Université de Santiago de Compostela en Espagne. Après deux stages postdoctoraux à l’Université Complutense de Madrid et la WWU Münster, il a intégré les équipes de PicoQuant GmbH. Après cinq années passées à aider les clients du monde entier dans les domaines de la FLIM et de la spectroscopie résolue en temps, il a rejoint Olympus Soft Imaging Solutions GmbH en 2017 pour occuper le poste de spécialiste international en applications. Il est notamment spécialisé dans l’analyse à haut contenu et l’apprentissage profond.

Résumé

Accelerating Image Analysis with TruAI™ Deep Learning Technology

Le développement du matériel informatique de microscopie a permis aux scientifiques de collecter de plus en plus de données d’image et ce, de manière très efficace et automatique. Toutefois, pour pouvoir extraire des informations quantitatives à partir de ces données, les images doivent être analysées de manière fiable.

La segmentation et la classification des images reposent grandement sur l’analyse des images. Plus les outils de segmentation et de classification des objets d’intérêt présents sur ses images sont efficaces, plus les informations quantitatives obtenues sont fiables, ce qui améliore la qualité des résultats.

En 2019, Olympus a lancé la technologie TruAI, une approche d’analyse des images basée sur des réseaux neuronaux profonds et axée sur la segmentation et la classification. La technologie TruAI permet de faciliter et de rendre accessibles la segmentation et la classification aux non-initiés, même dans les scénarios les plus difficiles, comme dans le cas d’images en fond clair à faible contraste ou d’images de fluorescence à faible rapport signal sur bruit, ou dans des scénarios de confluence cellulaire très dense. Une fois installée sur le microscope utilisé pour acquérir les images, la technologie TruAI permet d’accélérer vos recherches dès que les résultats d’analyse sont disponibles, à savoir peu de temps après que l’acquisition ait été terminée ou pendant l’acquisition.

Au cours de cette présentation technique illustrée par une série d’exemples mesurés avec nos systèmes d’imagerie de cellules vivantes, notre station de criblage à haut contenu et notre scanner de lames entières, vous verrez en quoi la technologie TruAI facilite vos travaux de recherche et pourrez avoir un aperçu des prochaines avancées technologiques.

Francesco Cardarelli

Biographie

Après avoir obtenu son master en sciences de la vie à l’Université de Pise en octobre 2003 et son diplôme d’études approfondies en sciences de la vie la même année (les deux avec les honneurs) de l’ENS de Pise, Francesco Cardarelli a travaillé au Laboratoire NEST de l’ENS de Pise en tant que doctorant en biophysique moléculaire sous la supervision du professeur Fabio Beltram. Il a commencé ses travaux de recherche interdisciplinaires au carrefour de la biologie cellulaire et de la physique en utilisant des méthodes de microscopie de fluorescence de pointe pour étudier les propriétés du transport de peptides viraux. Une fois diplômé, il a intégré en tant que chercheur postdoctoral le Laboratory for Fluorescence Dynamics de l’University of California at Irvine sous la supervision du professeur Enrico Gratton. Au sein de ce laboratoire, il a coordonné les activités de recherche pour la mise au point de nouveaux variants spatiaux utilisés en spectroscopie de corrélation de fluorescence en vue de détecter les freins à la diffusion moléculaire dans les cellules vivantes. En décembre 2010, il a été embauché par le CNI@NEST (IIT) en tant que chercheur postdoctoral. De retour en Italie, il a commencé à travailler sur de nouvelles méthodes d’analyse et d’imagerie basées sur la fluorescence afin d’étudier des molécules uniques dans des systèmes biologiques complexes avec une grande résolution spatiotemporelle. Grâce à ses nombreuses bourses (et ses collaborations) et à ses postes de scientifique indépendant, tout d’abord au CNR en tant que chercheur, puis à l’ENS en tant que professeur en physique appliquée, Francesco Cardarelli a eu la possibilité de donner un coup d’accélérateur à ses travaux de recherche.

Ceux-ci visent à mettre au point de nouvelles techniques de microscopie optique pour accroître la quantité d’informations quantitatives pouvant être extraites des expériences menées sur des échantillons vivants. Par exemple, ces dernières années, lui et son équipe ont introduit sur le marché de nouveaux outils d’analyse de fluctuation spatiotemporelle (iMSD, iRICS, nD-pCF, analyse par tenseur de diffusion, etc.) permettant d’extraire les propriétés structurelles et dynamiques d’objets biologiques allant des molécules jusqu’à des structures intracellulaires entières dans leur environnement naturel complexe. L’utilisation d’une telle boîte à outils est devenue essentielle pour les travaux de recherche en biophysique réalisés à l’échelle nanométrique, comme cela est présenté dans la section « New and Notable » du Biophysical Journal (2016 Aug 23; 111(4): 677–678). En 2014, lui et son équipe ont mis en évidence les mouvements browniens de courte portée des protéines dans le cytoplasme cellulaire et ont été parmi les premiers à contester la représentation actuelle de l’organisation structurelle dans le milieu intracellulaire bondé. Enfin, en associant cette boîte à outils au suivi orbital basé sur les rétroactions, ils ont démontré qu’il était possible d’étudier de façon quantitative l’environnement dynamique et nanoscopique des organites intracellulaires.

Résumé

Metabolic Imaging in Langerhans Human Islets with MPE and FLIM


Stefan Marawske

Spécialiste des ventes senior, systèmes de pointe pour les sciences de la vie
Olympus Europe

Heiko Gäthje

Formateur senior
Olympus Europe

Stefan Marawske

Biographie

Stefan Marawske est expert en microscopie à très super-résolution. Au cours de son doctorat en physicochimie, il a créé un microscope maison à super-résolution pour la localisation et le suivi des particules. Il a été fasciné par ces méthodes capables de briser la fameuse limite d’Abbe et de résoudre des structures qui ne pouvaient pas être identifiées auparavant. Il travaille pour Olympus depuis plus de sept ans et est responsable des systèmes d’imagerie de pointe tels que les microscopes TIRF et à disque rotatif.

Résumé

Live Demo: IXplore™ SpinSR Confocal Super Resolution System

Lors de cette démonstration en direct, découvrez le système IXplore SpinSR conçu pour l’imagerie 3D rapide à super-résolution et pour prolonger la viabilité des cellules dans les expériences d’imagerie à intervalle. Ce système de microscope assure une résolution XY allant jusqu’à 120 nm sans marquage spécifique. Découvrez comment facilement intégrer le microscope IXplore SpinSR à vos expériences et vos protocoles d’échantillonnage existants afin de simplifier vos recherches.

Heiko Gaethje

Biographie

En tant que biologiste travaillant sur le développement neuronal des insectes et la structure des protéines neuronales qui se lient à l’acide sialique chez les mammifères, Heiko Gaethje a acquis une expérience de première main de la microscopie de fluorescence confocale et à champ large et le traitement d’images de données 3D.

Heiko a rejoint Olympus en 2004 en tant que responsable du contenu Web au sein de l’équipe Marketing et communication. Depuis 2008, il a travaillé en tant que formateur en microscopie au sein de l’Olympus Academy et est responsable de la conception et du lancement des outils d’apprentissage numériques. En outre, il apporte son soutien et assure des formations sur la microscopie de pointe à l’EMBL Heidelberg et à la Zurich Winter School au cours desquelles il répond régulièrement à des questions relatives au traitement et à l’analyse des images.

Résumé

Deconvolution of 3D Image Stacks

Les images prises avec un microscope optique ne constituent pas des représentations fidèles de l’échantillon. Les sources d’erreur devant être contrôlées sont les protocoles de marquage et de préparation des échantillons ainsi que les aberrations et des limites du microscope et de la caméra numérique.

Pour transformer une image prise au microscope en une représentation fidèle de l’échantillon, des algorithmes de restauration sont utilisés. Aujourd’hui, nous allons voir la restauration des ensembles de données tridimensionnelles, un processus appelé déconvolution. Les notions mathématiques qui se cachent derrière ces méthodes ne seront pas abordées, l’objectif étant de vous donner une introduction rapide et intuitive qui vous permette d’évaluer les utilisations possibles de ces filtres dans une application spécifique. Pour cette raison, nous allons montrer le fonctionnement de ces filtres en direct sur des images d’exemple sélectionnées.


RJC (Bob) McLean, Ph.D.

Professeur distingué
Texas State University

James Lopez, Ph.D.

Responsable national des applications
Olympus America Inc.

RJC (Bob) McLean

Biographie

Bob McLean compte plus de 30 ans d’expérience en tant que microbiologiste. Au cours de cette période, lui et son équipe ont réalisé de nombreuses études sur les microorganismes adhérents aux surfaces (biofilms). En 1998, ils ont réalisé une expérience en collaboration avec John Glenn au sein de la navette spatiale au cours de laquelle ils ont été l’un des premiers groupes de recherche à montrer que des biofilms pouvaient se former en microgravité. Depuis cette découverte, de nombreux problèmes liés aux biofilms ont été recensés, notamment des cas d’encrassement du système de récupération des eaux de la station spatiale internationale et d’autres vaisseaux spatiaux. En 2015, Bob et ses collègues de l’Arizona State University et du Johnson Space Center ont reçu une bourse de la NASA pour étudier la formation des biofilms pendant les vols spatiaux. La microscopie confocale et d’autres types de microscopie ont joué un rôle essentiel dans ces expériences.

Résumé

Confocal Microscopy and Its Use for a Spaceflight Experiment

Les expériences réalisées en vol spatial constituent une opportunité scientifique rare, mais excitante. Contrairement aux expériences menées en laboratoire dont les protocoles peuvent être modifiés rapidement, les contraintes de temps de l’équipage et les problèmes de disponibilité des fournitures constituent des facteurs importants. Toute modification des dates du lancement du retour sur terre constitue également un problème. L’appareillage et les protocoles expérimentaux utilisés doivent être capables de fonctionner en microgravité tout en résistant aux forces g et aux vibrations des phases de décollage et d’atterrissage. Au cours de cette présentation, le Dr McLean décrira la planification d’une expérience menée récemment lors du vol spatial de la navette Space X-21 du 06/12/2020 au 14/01/2021 ainsi que les approches de microscopie confocale et électronique utilisées et analyses effectuées.

James Lopez

Biographie

James Lopez a obtenu en 2010 son doctorat en sciences biomédicales de l’University of Chicago. Après avoir passé une dizaine d’années à travailler sur l’imagerie calcique, la technique de transfert d’énergie entre molécules fluorescentes (FRET), l’imagerie de cellules vivantes et l’imagerie intravitale, James a rejoint Olympus en tant que représentant commercial pour les systèmes de microscopie confocale et multiphotonique. Il a ensuite intégré le groupe des applications des sciences de la vie pour les systèmes de microscopie confocale et multiphotonique. Aujourd’hui, il dirige le groupe des applications des sciences de la vie pour les marchés américain, canadien et latino-américain.

Résumé

Live demo: FLUOVIEW™ FV3000 Confocal Laser Scanning Microscope

Rejoignez James Lopez, Ph.D., responsable national des applications, pour découvrir comment le microscope laser confocal FV3000 peut accroître vos capacités de recherche et vous aider à extraire plus de données de vos échantillons.


Guo Lin, Ph.D.

Responsable, produits et applications
Olympus Singapour

Ewa Goldys, Ph.D.

Directrice adjointe
Australian Research Council Centre of Excellence in Nanoscale Biophotonics

Guo Lin

Biographie

Guo Lin a obtenu son doctorat en biophysique de la National University of Singapore en 2010. En 2009, il a rejoint Olympus en tant que spécialiste technique et des applications responsable des systèmes d’imagerie laser de pointe. En 2012, il a décidé de retourner en Chine et a accepté un poste chez un des fabricants leaders du marché de la caméra scientifique. Au sein de cette entreprise, il a commencé comme spécialiste des applications, puis est devenu responsable régional des ventes, pour finir responsable scientifique des ventes pour la région Asie-Pacifique. En 2021, il est revenu à Singapour et a rejoint à nouveau Olympus Singapour en tant que responsable des produits et des applications. Lin a acquis une grande expérience de divers techniques d’imagerie numérique scientifique et de caméra.

Résumé

Evolution of Scientific Digital Imaging Technologies and its Applications

Si un microscope optique joue un rôle essentiel pour la production d’images en haute résolution et à contraste élevé, la numérisation de l’image observée à travers l’oculaire est tout aussi importante. Cela permet d’augmenter de manière significative votre capacité à mettre en évidence certaines caractéristiques, à extraire des informations et à faire progresser vos recherches.

Nous avons connu de nombreuses avancées depuis les débuts de l’acquisition des images. En effet, nous sommes passés de la photomicrographie sur un film à une imagerie numérique hautement sensible capable de détecter des molécules isolées. L’imagerie numérique a non seulement permis aux scientifiques d’enregistrer leurs données, mais également de les analyser au moyen de nouveaux logiciels dotés d’intelligence artificielle.

Les caméras numériques conçues pour les sciences de la vie ont considérablement évolué, et de nombreuses nouvelles technologies sont aujourd’hui disponibles. Des capteurs photographiques CCD aux capteurs EMCCD en passant par les capteurs sCMOS, chaque technologie présente ses avantages et ses inconvénients et doit être choisie avec soin en fonction de l’application pour laquelle elle est destinée .

Au cours de cette présentation, je décrirai certains des aspects les plus importants à connaître lors du choix d’une caméra numérique à usage scientifique. Je parlerai également de l’évolution de ces caméras, de la solution proposée par Olympus, de la manière d’utiliser les caméras avec les systèmes de microscopie de pointe actuels pour diverses applications.

Ewa Goldys

Biographie

La professeure Ewa M. Goldys est directrice adjointe de l’Australian Research Council Centre of Excellence in Nanoscale Biophotonics (cnbp.org.au) et professeure à la Graduate School of Biomedical Engineering, University of New South Wale, Sydney, Australie. Elle est membre du SPIE, de l’OSA, de Australian Academy of Technological Science and Engineering (ATSE) et est lauréate 2016 du Prix Eureka de l’Australian Museum, mention « Utilisation innovante des technologies ». Elle s’est toujours impliquée dans le SPIE BIOS, la plus grande convention internationale sur les composants optiques biomédicaux au monde, et la conférence Photonics West du SPIE dans laquelle elle a servi de présidente de la session sur les nanobiophotoniques.

Ses travaux de recherche couvrent les sciences biomédicales, la bio-imagerie, la biodétection et les sciences des matériaux. Elle a mis au point des approches novatrices pour la détection biochimique et médicale et les diagnostics médicaux déployables. Ses projets actuels se concentrent sur l’utilisation des nanotechnologies dans le domaine du cancer et l’imagerie non-invasive à haut contenu des couleurs et formes dans les cellules et les tissus.

Résumé

Hyperspectral and Brightfield Imaging Combined with Deep Learning Uncovers Hidden Regularities of Colors and Patterns in Cells and Tissues

L’Australian Research Council Centre of Excellence for Nanoscale Biophotonics puise dans les avancées clés du XXIe siècle, les nanosciences et la photonique pour comprendre la vie à l’échelle moléculaire. Au cours de cette présentation, nous vous verrons les technologies de nouvelle génération développées au sein de notre centre pour étudier et imager les systèmes vivants et interagir avec les systèmes vivants. Ces technologies permettent de relever les défis liés à la détection ultrasensible d’analytes essentiels dans des environnements complexes in vivo et à la complexité moléculaire et de développer des traitements et des diagnostics innovants.


Akira Saito

Directeur adjoint, marketing et applications
Olympus Singapour

Sara Quiñones Gonzalez

Responsable de produit
Olympus Soft Imaging Solutions

Akira Saito

Biographie

Akira a étudié la médecine vétérinaire à la Tokyo University of Agriculture and Technology au Japon et a obtenu son diplôme en 2007. Il a ensuite rejoint les équipes Olympus en tant que spécialiste des applications responsables des systèmes d’imagerie in vivo, des systèmes d’analyse à haut contenu et des systèmes laser confocaux pour l’assistance aux clients installés au Japon. En 2013, il a reçu une promotion et est devenu responsable des ventes pour tous les produits de la gamme Olympus pour les sciences de la vie. Depuis 2018, il est installé à Singapour où il encadre l’équipe du marketing et des applications pour la région Asie-Pacifique.

Résumé

A New Way of Thinking—Object Detection with Deep Learning

L’analyse des images est largement utilisée en sciences de la vie pour quantifier et comprendre les événements dans les échantillons biologiques. La détection et la segmentation des objets constituent des processus clés pour l’analyse des images en vue de l’identification des zones d’intérêt sur les images. Elles permettent alors de quantifier des informations morphologiques, des intensités, la vitesse de suivi, etc.

La segmentation conventionnelle n’a pas toujours été précise et efficace, mais nos yeux et notre cerveau sont capables, par expérience, de reconnaître où sont situées les zones d’intérêt. En utilisant l’apprentissage profond, nous pouvons entraîner un réseau neuronal à partir d’informations fiables pour réaliser cette tâche complexe. Une fois le réseau neuronal correctement créé, il peut être utilisé pour segmenter les objets comme le ferait votre cerveau. Lorsque l’on parle d’apprentissage profond, on s’attend toujours à ce que cela nécessite des compétences de programmation, mais notre logiciel n’en requiert pas et est facile à utiliser.

Lors de cette session, nous aborderons la segmentation des objets par apprentissage profond et ses applications aux sciences de la vie. Nous ferons également une démonstration du logiciel d’apprentissage profond Olympus.

Sara Gonzalez

Biographie

Sara Quiñones González est diplômée en biotechnologie et a travaillé au sein de plusieurs laboratoires cliniques et de recherche avant de rejoindre Olympus Soft Imaging Solutions en 2019 en tant que responsable de produit. Elle s’occupe de la famille de produits SLIDEVIEW, notamment le scanner de lames pour la recherche VS200.

Résumé

Live Demo: SLIDEVIEW™ VS200 Research Slide Scanner

Lors de cette démonstration en direct, vous apprendrez à acquérir des images de haute résolution de vos lames en vue d’une analyse quantitative afin de tirer le plus d’informations possible de vos lames. Analysez, partagez et archivez vos données facilement grâce au scanner de lames numérique SLIDEVIEW VS200. Rejoignez cette session et découvrez comment recueillir plus d’informations plus rapidement.


Wei Juan Wong

Spécialiste en applications
Olympus Soft Imaging Solutions

Laura Vittadello, Ph.D.

Département de physique et Center of Cellular Nanoanalytics
Osnabrück University

Wei Juan Wong

Biographie

Wei Juan Wong possède un diplôme en physique et a travaillé au sein d’un laboratoire de recherche en biophysique ainsi que dans un service de microscopie. Elle a rejoint Olympus Singapour en 2018 en tant que spécialiste de produit pour aider les clients d’Asie du sud-est utilisant des microscopes à champ large, notamment le scanner de lames VS200. En 2021, elle a déménagé en Allemagne pour rejoindre Olympus Soft Imaging Solutions en tant que spécialiste des applications. À ce poste, elle s’occupe du soutien au marketing et aux applications pour les clients du monde entier.

Résumé

Live Demo: SLIDEVIEW™ VS200 Research Slide Scanner

Lors de cette démonstration en direct, vous apprendrez à acquérir des images de haute résolution de vos lames en vue d’une analyse quantitative afin de tirer le plus d’informations possible de vos lames. Analysez, partagez et archivez vos données facilement grâce au scanner de lames numérique SLIDEVIEW VS200. Rejoignez cette session et découvrez comment recueillir plus d’informations plus rapidement.

Dr Laura Vittadello

Biographie

Le Dr Laura Vittadello effectue un stage post-doctoral au sein du groupe de recherche en physique ultrarapide du département de Physique de Osnabrück University. Ses travaux de recherche portent sur l’étude fondamentale et l’application d’un nouveau type de marqueur, les nanoparticules harmoniques, spécialement conçues pour les applications biologiques impliquant la microscopie non linéaire.

Résumé

In-Vivo Tracking of Harmonic Nanoparticles by Means of a TIGER Widefield Microscope

Le suivi in vivo basé sur les nanoparticules harmoniques n’a jusqu’à présent pas été exploité à cause de l’absence d’un outil adapté, à savoir un microscope optique non linéaire à champ large. Nous vous présenterons une nouvelle approche qui vous permettra de relever ce défi et qui est basée sur une nouvelle conception des paramètres spatiaux du laser.


Bülent Peker

Directeur marketing produit senior
Olympus Europe

Ruben Portugues, Ph.D.

Institute of Neuroscience
Technical University of Munich

Bülent Peker

Biographie

Bülent Peker est expert en microscopie à balayage laser. Il a commencé à développer un intérêt pour la microscopie et la photonique lors de son doctorat en physicochimie, au cours duquel il a travaillé sur la microscopie à deux photons résolue en temps, une passion qui l’accompagne depuis lors.

Bülent travaille chez Olympus depuis plus de 13 ans et est à l’origine, avec son équipe, de la commercialisation de microscopes à balayage laser de pointe. Il est particulièrement fasciné par l’application des systèmes multiphotoniques et les possibilités de personnalisation des systèmes à balayage laser.

Résumé

Live Demo: FLUOVIEW™ FV3000 Confocal Laser Scanning Microscope

Lors de cette démonstration en direct, vous découvrirez le microscope FluoView™ FV3000 d’Olympus qui permet de réaliser des tâches d’imagerie de tissus profonds et de multiplexage de fluorescence au moyen de lumière laser proche infrarouge. Les lasers en proche infrarouge permettent de mieux visualiser avec une meilleure résolution les structures biologiques situées en profondeur dans un échantillon. L’excitation par le proche infrarouge permet également d’utiliser plus de fluorochromes sans chevauchement des spectres.

Dr Ruben Portugues

Biographie

Le professeur Portugues est un neurobiologiste qui étudie le contrôle sensorimoteur. Avec son groupe de recherche, il utilise les comportements, la modélisation, l’optogénétique, l’électrophysiologie in vivo et l’imagerie calcique fonctionnelle du cerveau entier pour décrypter les mécanismes d’apprentissage, de mémorisation et de sélection d’action de larves de poissons-zèbres.

Il a étudié les mathématiques et a effectué un doctorat en physique théorique au Trinity College de l’University of Cambridge. Après un court stage post-doctoral au Centro de Estudios Cientificos de Valdivia (Chili), il a intégré le laboratoire du professeur Florian Engert à l’Harvard University où il a mené des recherches en neurosciences. En 2014, il a été nommé directeur du groupe de recherche Max Planck au Max Planck Institute of Neurobiology de Martinsried en Allemagne. Depuis 2020, il est professeur adjoint à la TUM.

Résumé

Alpha3 Light Sheet Application

Olympus Discovery Summit : une qualité d’image inégalée | 26 - 27 octobre 2021avril 25 2024
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