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深度学习:开启新应用的大门

深度学习:开启新应用的大门

Join Manoel和Kathy将为您解读如何通过发挥深度学习威力应对诸如在明场图像中检测细胞以及进行人眼难以胜任的细胞分类等挑战性图像分析任务。

主持人:

Manoel Veiga,生命科学研究应用专家 
Kathy Lindsley,生命科学应用专家

常见问题解答

网络研讨会常见问题解答 | 深度学习

可以使用深度学习算法进行定量强度测量吗?

深度学习算法可以预测荧光信号的定位,但无法预测强度。但是,您可以利用深度学习进行目标分割,然后对其它通道如荧光通道进行定量强度分析。

比如无标记方式分析蛋白表达量,需要以极低功率光照射标本,那么可以在明场图像中进行目标分割,然后测量荧光通道信号。只要背景恒定,即便信号强度低,哪怕仅比相机噪声高一点点,也可以执行定量分析。

可以将深度学习软件用于组织染色切片(如HE染色)吗?

可以,cellSens™软件具备可用于RGB图像分析的特殊深度学习神经网络。RGB神经网络可以精细修改不同颜色的增强值,从而确保深度学习神经网络对于RGB图像的微小变化和颜色平衡具有鲁棒性。

深度学习软件需要训练多少幅图像?

关键参数是带有注释的对象数,而非图像数。有时候20到30个对象即可,但在这种情况下您只能使用该神经网络分析具有相似对比度的图像。如果想要对不同类型的图像进行无标记分析,那么通常需要成千上万的注释。比如,可以应用荧光的自动化ground truth满足这种较高水平的注释要求。

奥林巴斯深度学习算法是否基于U-Net?

是的,这一算法受U-Net启发而开发。其并非完全相同,但总体结构基于U-Net。

深度神经网络和卷积神经网络有何区别?

神经网络具有输入层和输出层。一个深度神经网络在输入层和输出层之间至少要有一个中间层(通常有多个中间层)。卷积神经网络是中间层相互卷积的一种深层神经网络类型。卷积是一种非常适合成像分析的数学运算,因而广泛用于显微镜图像分析。深度学习还应用于图像分析之外的其他领域。这类应用不需要卷积网络,而是使用其他类型的网络。


相关产品

成像软件

cellSens

cellSens软件的用户界面可自定义,提供直观的操作和流畅无缝的工作流程,让您可以控制布局。cellSens软件具有一系列软件包,可提供各种针对您的具体成像需求进行了优化的功能。它的图形化试验管理器和孔导航器功能简化了5D图像采集。通过TruSight反卷积实现更高的分辨率,并使用会议模式共享图像。

  • 通过TruAI深度学习分割分析提高实验效率,从而提供非标记细胞核检测和细胞计数
  • 模块化成像软件平台
  • 直观的应用驱动型用户界面
  • 从简单的捕获到高级多维实时实验的大范围功能集

深度学习:开启新应用的大门

Join Manoel和Kathy将为您解读如何通过发挥深度学习威力应对诸如在明场图像中检测细胞以及进行人眼难以胜任的细胞分类等挑战性图像分析任务。

常见问题解答

网络研讨会常见问题解答 | 深度学习

可以使用深度学习算法进行定量强度测量吗?

深度学习算法可以预测荧光信号的定位,但无法预测强度。但是,您可以利用深度学习进行目标分割,然后对其它通道如荧光通道进行定量强度分析。

比如无标记方式分析蛋白表达量,需要以极低功率光照射标本,那么可以在明场图像中进行目标分割,然后测量荧光通道信号。只要背景恒定,即便信号强度低,哪怕仅比相机噪声高一点点,也可以执行定量分析。

可以将深度学习软件用于组织染色切片(如HE染色)吗?

可以,cellSens™软件具备可用于RGB图像分析的特殊深度学习神经网络。RGB神经网络可以精细修改不同颜色的增强值,从而确保深度学习神经网络对于RGB图像的微小变化和颜色平衡具有鲁棒性。

深度学习软件需要训练多少幅图像?

关键参数是带有注释的对象数,而非图像数。有时候20到30个对象即可,但在这种情况下您只能使用该神经网络分析具有相似对比度的图像。如果想要对不同类型的图像进行无标记分析,那么通常需要成千上万的注释。比如,可以应用荧光的自动化ground truth满足这种较高水平的注释要求。

奥林巴斯深度学习算法是否基于U-Net?

是的,这一算法受U-Net启发而开发。其并非完全相同,但总体结构基于U-Net。

深度神经网络和卷积神经网络有何区别?

神经网络具有输入层和输出层。一个深度神经网络在输入层和输出层之间至少要有一个中间层(通常有多个中间层)。卷积神经网络是中间层相互卷积的一种深层神经网络类型。卷积是一种非常适合成像分析的数学运算,因而广泛用于显微镜图像分析。深度学习还应用于图像分析之外的其他领域。这类应用不需要卷积网络,而是使用其他类型的网络。


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  • 通过TruAI深度学习分割分析提高实验效率,从而提供非标记细胞核检测和细胞计数
  • 模块化成像软件平台
  • 直观的应用驱动型用户界面
  • 从简单的捕获到高级多维实时实验的大范围功能集
Experts
Kathy Lindsley
生命科学应用应用专家

我是Kathy Lindsley,是奥林巴斯为基于相机成像系统提供支持的应用专家。我拥有爱荷华州立大学生物化学专业的理学学士学位。我于2006年加入奥林巴斯,担任研究成像销售代表,并于2012年加入生命科学应用团队。在加入奥林巴斯之前,我曾在学术研究领域担任过15年的研究助理,在膜片钳、钙成像、组织培养和免疫组织化学方面积累了丰富的经验。

Manoel Veiga
生命科学研究应用专家
Olympus Soft Imaging Solutions

大家好。我叫Manoel Veiga,是奥林巴斯软件深度学习实施团队成员。我于2017年加入奥林巴斯,拥有高内涵筛选、图像分析和深度学习领域的专业知识。我还是荧光寿命成像的专家。

在攻读物理化学博士学位期间,我开始对数据分析产生兴趣,在了解到卷积神经网络的强大功能及其所能完成难以置信的图像分析任务之后,更加加深了我对这一领域的兴趣。

深度学习:开启新应用的大门2024年4月19日
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