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Vue d’ensemble

	Station de criblage à haut contenu modulaire pour les sciences du vivant La plateforme d’imagerie microscopique modulaire assure l’acquisition entièrement automatisée des images et l’analyse des données d’échantillons biologiques par une technologie d’apprentissage profond. Contactez-nous

Station de criblage à haut contenu modulaire pour les sciences du vivant

La plateforme d’imagerie microscopique modulaire assure l’acquisition entièrement automatisée des images et l’analyse des données d’échantillons biologiques par une technologie d’apprentissage profond.

Contactez-nous

Matériel adaptable et modulaire

La station de criblage scanR combine la modularité et la flexibilité d’un système microscopique avec l’automatisation, la vitesse et le débit nécessaires pour le criblage à haut contenu. Parfaitement adaptée aux analyses standard et au développement d’analyses, la conception modulaire permet d’adapter la station scanR aux applications de recherche et développement dans le domaine de la biologie ou aux environnements multi-utilisateurs.

Système confocal à disque rotatif

Compatible avec le système de microscope à super-résolution Olympus IXplore SpinSR intégrant le scanner Yokogawa CSU-W1
Les disques de microlentilles et l’excitation au laser produisent une qualité d’image confocale parfaite à haute vitesse

Système de chargement robotisé

Utilisez la station avec un robot de chargement de plaques pour des criblages à haut débit entièrement automatisés

Système d’incubation

Ajoutez n’importe quel système d’incubation compatible avec l’IX83 pour un contrôle rigoureux de la température, de l’humidité et du taux de CO2

Systèmes de TIRF et de FRAP (avec le logiciel cellSens)

Utilisez les microscopes de la gamme Olympus IXplore et le logiciel cellSens pour réaliser des expériences d’imagerie avancées de type TIRF et FRAP

Related Videos	Logiciel complet La conception souple du système lui permet de satisfaire aux exigences de l’imagerie quantitative et de l’analyse d’image dans les domaines de la biologie cellulaire, de la biologie moléculaire, de la biologie des systèmes et de la recherche médicale modernes. Acquisition des images et analyse des données des échantillons biologiques entièrement automatisées Conçu pour les plaques multipuits, les lames et les biopuces conçues sur mesure Module d’analyse puissant pour les analyses biologiques fonctionnelles Idéal pour le développement des analyses et le criblage à haut contenu Adapté aux cellules fixées et vivantes

Logiciel complet

La conception souple du système lui permet de satisfaire aux exigences de l’imagerie quantitative et de l’analyse d’image dans les domaines de la biologie cellulaire, de la biologie moléculaire, de la biologie des systèmes et de la recherche médicale modernes.

Acquisition des images et analyse des données des échantillons biologiques entièrement automatisées
Conçu pour les plaques multipuits, les lames et les biopuces conçues sur mesure
Module d’analyse puissant pour les analyses biologiques fonctionnelles
Idéal pour le développement des analyses et le criblage à haut contenu
Adapté aux cellules fixées et vivantes

Satisfait aux besoins de nombreuses analyses

Le système scanR est idéal pour les applications de recherche de nouveaux médicaments, notamment pour mettre en évidence les effets biochimiques des composés au niveau cellulaire et les changements induits par les médicaments au niveau de l’expression génique. La solution peut mesurer l’apoptose, les micronoyaux ou la fragmentation de l’ADN (tests des comètes) et couvre une grande variété d’applications de criblage :

Numération cellulaire
Expression génique
Transport intracellulaire
Translocation
Prolifération cellulaire
Analyse des corps nucléaires PML (leucémie promyélocytaire)
Analyses d’infection bactérienne et virale
Analyse du cycle cellulaire
Cribles sur biopuces cellulaires
Localisation et colocalisation des protéines
Analyses de cellules vivantes avec analyse cinétique et fenêtrage sur les courbes de réponse qui en résultent
Analyses multicolores
Analyse des événements rares
Analyse FISH automatisée
Analyse de la fluorescence dans les coupes de tissus
Migration cellulaire

Criblage de l’ensemble du génome sur des puces cellulaires en vue de l’identification de nouveaux gènes impliqués dans la machinerie du transport intracellulaire. Image reproduite avec l’aimable autorisation du Dr R. Peperkok, EMBL, Heidelberg, Allemagne

Analyse d’infection à Chlamydia trachomatis. Image reproduite avec l’aimable autorisation du Dr S. Hess, Institut Max Planck de Biologie Infectieuse, Berlin, Allemagne.

Segmentation de cellules binucléées et numération des micronoyaux. Image reproduite avec l’aimable autorisation du Department for In-Vitro Toxicology, Fraunhofer Institute Toxicology and Experimental Medicine (ITEM), Hanovre, Allemagne

Segmentation de cellules binucléées et numération des micronoyaux. Images reproduites avec l’aimable autorisation Department for In-Vitro Toxicology, Fraunhofer Institute Toxicology and Experimental Medicine (ITEM), Hanovre, Allemagne.

Un système modulaire d’une grande souplesse

La solution scanR satisfait non seulement aux exigences spécifiques de rapidité, d’endurance et de fiabilité d’un système de criblage à haut contenu entièrement automatisé, mais elle offre également une flexibilité et une adaptabilité inégalées avec de vastes capacités d’extension. Cela permet au système scanR de se conformer aux spécifications d’un plus grand nombre d’applications et de budgets. Ajoutez des modules avec les fonctionnalités suivantes à votre système :

Microscopie avec autoapprentissage s’appuyant sur une technologie d’apprentissage profond
Mesure des paramètres cinétiques
Déconvolution 3D à haute vitesse
Mise au point automatique à laser infrarouge (IR) (basée sur le IX83 ZDC)
… et bien d’autres encore

Contactez nos spécialistes des applications pour adapter votre système à vos applications

Déconvolution à haute vitesse

La déconvolution à haute vitesse du système TruSight

Comparaison entre l’observation en champ large, la déconvolution 2D et la déconvolution 3D détectant les fines structures d’échantillons sans compromettre le débit.

Système TruFocus avec mise au point automatique à laser infrarouge (IR)

Le mode amélioré de mise au point automatique en continu maintient une mise au point précise sur le plan d’observation souhaité, y compris lors de l’ajout de réactifs ou lors de variations de la température ambiante.

Microscopie avec autoapprentissage s’appuyant sur une technologie d’apprentissage profond

Microscopie avec autoapprentissage avec une technologie d’apprentissage profond

De gauche à droite : prédiction de l’IA des positions des noyaux (bleu), noyaux mis en évidence par les signaux de l’histone 2B étiquetée avec la protéine fluorescence verte (GFP) (vert) et image brute en fond clair en lumière transmise.

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Technologies appliquées

Fenêtrage et classification Les concepts puissants d’analyse des données appliqués avec succès à la cytométrie sont parfaitement adaptés aux exigences des analyses des grands ensembles de données d’image. Les données d'image multidimensionnelle sont représentées dans des diagrammes de dispersion bidimensionnels ou des histogrammes unidimensionnels ; les groupes de données d'intérêt sont sélectionnables à l'aide d'outils graphiques. Les fenêtres de classification de différents diagrammes peuvent être combinées avec des opérateurs Boolean pour créer des schémas de classification complexes.	Une approche de fenêtrage hiérarchique permet une sélection intuitive des populations, qui peuvent également être visualisées dans les galeries.

Fenêtrage et classification

Les concepts puissants d’analyse des données appliqués avec succès à la cytométrie sont parfaitement adaptés aux exigences des analyses des grands ensembles de données d’image.
Les données d'image multidimensionnelle sont représentées dans des diagrammes de dispersion bidimensionnels ou des histogrammes unidimensionnels ; les groupes de données d'intérêt sont sélectionnables à l'aide d'outils graphiques.
Les fenêtres de classification de différents diagrammes peuvent être combinées avec des opérateurs Boolean pour créer des schémas de classification complexes.

Une approche de fenêtrage hiérarchique permet une sélection intuitive des populations, qui peuvent également être visualisées dans les galeries.

Prise en main rapide

Grâce aux modèles de réseaux neuronaux pré-entraînés inclus, vous pouvez commencer à utiliser l'IA rapidement. Les modèles pré-entraînés vous permettent de commencer à détecter des noyaux et des cellules dans la plupart des conditions standard. Même les cellules confluentes et les noyaux denses peuvent être distingués de manière fiable.

Les mesures de contrôle et de validation sont intégrées pour garantir la précision et la fiabilité des résultats d’analyse par l’IA.

Segmentation précise des objets : données brutes (à gauche), segmentation par seuil standard (au milieu), segmentation par instance TruAI (à droite). La segmentation par instance sépare de manière fiable les objets difficiles à distinguer qui sont très proches les uns des autres, comme les cellules ou les noyaux dans les colonies ou les tissus.

Détail d’une capture d’écran après l’acquisition de données par scanR illustrant la détection et la séparation des marqueurs. Reproduit avec l’aimable autorisation du Dr R. Pepperkok, EMBL Heidelberg, Allemagne.	Détection et analyse des objets De puissants modules de détection des objets segmentent les noyaux, les cellules ou d’autres structures. Sélectionnez plusieurs algorithmes de détection et adaptez-les aux objets d’intérêt. Sur la base des résultats de la segmentation, les caractéristiques à extraire peuvent être sélectionnées dans une liste de plus de 100 paramètres d’objet. Permet une grande variété de tests cellulaires.

Détail d’une capture d’écran après l’acquisition de données par scanR illustrant la détection et la séparation des marqueurs. Reproduit avec l’aimable autorisation du Dr R. Pepperkok, EMBL Heidelberg, Allemagne.

Détection et analyse des objets

De puissants modules de détection des objets segmentent les noyaux, les cellules ou d’autres structures.
Sélectionnez plusieurs algorithmes de détection et adaptez-les aux objets d’intérêt.
Sur la base des résultats de la segmentation, les caractéristiques à extraire peuvent être sélectionnées dans une liste de plus de 100 paramètres d’objet.
Permet une grande variété de tests cellulaires.

Contrôle immédiat de la qualité Les images et les objets sont réciproquement liés à leurs points de données respectifs : Cliquer sur un point de données charge l’image correspondante dans la fenêtre d’affichage et met en évidence l’objet en question. Cliquer sur un objet dans la fenêtre d’affichage de l’image met en évidence les points de données associés dans les diagrammes de dispersion et les histogrammes. Créez une galerie de toutes les images d’une population de données sélectionnées ou fenêtrées pour permettre la comparaison visuelle directe de plus grands ensembles d’images avec les informations pertinentes qui y sont associées.	Les résultats sont visualisés sur des cartes de densité ou exportés dans des tableaux. L’affichage d’une vue d’ensemble des puits entiers est très simple.

Contrôle immédiat de la qualité

Les images et les objets sont réciproquement liés à leurs points de données respectifs :

Cliquer sur un point de données charge l’image correspondante dans la fenêtre d’affichage et met en évidence l’objet en question.
Cliquer sur un objet dans la fenêtre d’affichage de l’image met en évidence les points de données associés dans les diagrammes de dispersion et les histogrammes.

Créez une galerie de toutes les images d’une population de données sélectionnées ou fenêtrées pour permettre la comparaison visuelle directe de plus grands ensembles d’images avec les informations pertinentes qui y sont associées.

Les résultats sont visualisés sur des cartes de densité ou exportés dans des tableaux. L’affichage d’une vue d’ensemble des puits entiers est très simple.

Related Videos	Acquisition à plusieurs niveaux Après un prébalayage initial, le logiciel d’analyse scanR peut identifier tous les objets d’intérêt potentiels. Dans un mode opératoire automatisé, les résultats de l’analyse sont utilisés pour scanner de manière sélective les objets d’intérêt dans un deuxième écran ciblé.

Acquisition à plusieurs niveaux

Après un prébalayage initial, le logiciel d’analyse scanR peut identifier tous les objets d’intérêt potentiels. Dans un mode opératoire automatisé, les résultats de l’analyse sont utilisés pour scanner de manière sélective les objets d’intérêt dans un deuxième écran ciblé.

Mesure des paramètres cinétiques avec le module Kinetic Classez les cellules vivantes, les noyaux et les autres objets en fonction de leurs propriétés variables dans le temps. Évaluez les courbes de suivi en fonction de différentes valeurs (paramètres statiques moyens tels que l’intensité, la surface, le rapport, le facteur de forme, etc.) mesurées dans le temps. Évaluez et analysez les paramètres statiques comme l’intensité ou le rapport entre les marqueurs fluorescents, la position, la taille ou la forme au fil du temps. Les courbes sont condensées en des valeurs de caractéristiques uniques (paramètres cinétiques). Représentez les paramètres cinétiques dans des histogrammes 1D ou 2D, et classifiez les populations en fonction de leurs propriétés spécifiques qui varient dans le temps.	Cellules souches embryonnaires humaines (CSEh) exprimant le biocapteur FUCC (CA). Reproduit avec l’aimable autorisation du Dr Silvia Santos, Francis Crick Institute, Londres, Royaume-Uni.

Mesure des paramètres cinétiques avec le module Kinetic

Classez les cellules vivantes, les noyaux et les autres objets en fonction de leurs propriétés variables dans le temps.
Évaluez les courbes de suivi en fonction de différentes valeurs (paramètres statiques moyens tels que l’intensité, la surface, le rapport, le facteur de forme, etc.) mesurées dans le temps.
Évaluez et analysez les paramètres statiques comme l’intensité ou le rapport entre les marqueurs fluorescents, la position, la taille ou la forme au fil du temps.
Les courbes sont condensées en des valeurs de caractéristiques uniques (paramètres cinétiques).
Représentez les paramètres cinétiques dans des histogrammes 1D ou 2D, et classifiez les populations en fonction de leurs propriétés spécifiques qui varient dans le temps.

Cellules souches embryonnaires humaines (CSEh) exprimant le biocapteur FUCC (CA). Reproduit avec l’aimable autorisation du Dr Silvia Santos, Francis Crick Institute, Londres, Royaume-Uni.

	Combinez l’imagerie de pointe et l’analyse à haut contenu Utilisez le logiciel d’imagerie de cellules vivantes cellSens sur le même système que la solution scanR de sorte à pouvoir utiliser simultanément la même configuration pour le criblage et l’imagerie de pointe. Obtenez des détails d’image de très grande qualité pour les applications de criblage les plus exigeantes en utilisant des algorithmes de déconvolution itérative contrainte 2D et 3D. Les algorithmes, rapides et simples d’utilisation, éliminent le flou et le bruit de fond pour mettre en évidence les détails structurels essentiels. Utile pour une analyse en profondeur nécessitant des détails structurels en haute résolution.

Une combinaison de deux systèmes

Combinez l’imagerie de pointe et l’analyse à haut contenu

Utilisez le logiciel d’imagerie de cellules vivantes cellSens sur le même système que la solution scanR de sorte à pouvoir utiliser simultanément la même configuration pour le criblage et l’imagerie de pointe.
Obtenez des détails d’image de très grande qualité pour les applications de criblage les plus exigeantes en utilisant des algorithmes de déconvolution itérative contrainte 2D et 3D.
Les algorithmes, rapides et simples d’utilisation, éliminent le flou et le bruit de fond pour mettre en évidence les détails structurels essentiels.
Utile pour une analyse en profondeur nécessitant des détails structurels en haute résolution.

Microscopie avec autoapprentissage

La microscopie avec autoapprentissage ouvre de nouveaux horizons dans l’analyse à haut contenu. Les applications vont de la segmentation des images et des tâches de classification auparavant impossibles à l’analyse quantitative de signaux d’intensité extrêmement faible, ce qui simplifie les protocoles de marquage, les analyses sans marqueur, etc.

Microscopie avec autoapprentissage

Exemple de procédure utilisant la microscopie avec autoapprentissage pour générer un modèle d’IA pour effectuer une analyse sans marqueur d’images en fond clair difficiles à analyser. Le noyau des cellules HeLa est marqué à la GFP pour la phase d’entraînement afin de montrer au système comment analyser les images en fond clair.

Lire l’article technique

Une nouvelle façon de penser

Exemple d’application : segmentation fiable des noyaux cellulaires à différents niveaux de signal permettant une réduction importante de l’exposition lumineuse pour l’analyse quantitative.

L’utilisateur a un contrôle total de la conception de l’expérience d’entraînement.

Il est possible de couvrir de nombreuses conditions d’analyse difficiles pendant la phase d’entraînement.

Le protocole analytique appris par IA peut être validé simplement et de manière approfondie avec l’interface unique d’exploration et d’analyse de données du logiciel.

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Caractéristiques techniques

Potence du microscope	Microscope inversé IX83 d’Olympus, une ou deux plateformes de montage Platine motorisée, Märzhäuse SCAN IM 120 × 80 pour le microscope IX83 d’Olympus
Options d’éclairage à DEL pour la fluorescence	Lumencor SpectraX : 6 canaux DEL indépendants CoolLED pE-300ultra : 3 canaux DEL indépendants Filtres passe-bande optimisés pour des applications particulières Durée de vie > 20 000 heures
Options d’éclairage en lumière transmise	Éclairage en lumière transmise pour inspection visuelle uniquement (pas de criblage en lumière transmise) Éclairage en lumière transmise pour le criblage et l’inspection visuelle comprenant un obturateur rapide (criblage en lumière transmise pris en charge) CID (contraste interférentiel différentiel) ou contraste de phase en option
Contrôle du matériel et synchronisation du système (en option)	Contrôleur en temps réel avec unité centrale supplémentaire indépendant du système d’exploitation du PC d’imagerie Résolution temporelle : 1 ms Précision temporelle : < 0,01 ms Acquisition multitâche synchronisée avec le matériel (contrôle de l’éclairage, filtres d’émission, obturateurs, etc.) Commande précise de la caméra au moyen d’un déclencheur externe
Options de caméra	Hamamatsu ORCA-Flash 4.0 V3 : caméra à capteur sCMOS haute sensibilité refroidi avec grande puce de capteur de 18,8 mm (0,74 po) Hamamatsu ORCA-Flash 4.0 LT : caméra à capteur sCMOS économique avec grande puce de capteur de 18,8 mm (0,74 po) Hamamatsu ORCA-Fusion, caméra à capteur sCMOS avec grande puce de capteur de 21,2 mm (0,83 po) Hamamatsu ORCA-Fusion BT : caméra sCMOS à très faible niveau de bruit avec grande puce de capteur de 21,2 mm (0,83 po)
Options d’objectif (compatible avec les objectifs X Line d’Olympus)	Objectifs pour substrats « minces » (de 0,1 à 0,2 mm [de 0,004 à 0,008 po]), lamelles couvre-objet et plaques à fond en verre (2X, 4X, 10X, 20X, 40X, 60X, 100X) Objectifs pour substrats « épais » (~1 mm [0,04 po]), plaques à fond en plastique et lames (2X, 4X, 10X, 20X, 40X, 60X, 100X) Objectifs de contraste de phase pour substrats « minces » (de 0,1 à 0,2 mm [de 0,004 à 0,008 po]), lamelles couvre-objet et plaques à fond en verre (10X, 20X, 40X) Objectifs de contraste de phase pour substrats « épais » (~1 mm [0,04 po]), lamelles couvre-objet et plaques à fond en verre (10X, 20X, 40X)
Jeux de filtres	Jeux de filtres monobandes (caractéristiques techniques sur demande) Jeux de filtres multibandes (caractéristiques techniques sur demande)
Système scanR Logiciel	2 modules logiciels indépendants : le logiciel d’acquisition scanR et le logiciel d’analyse scanR Procédure de correction de l’ombrage pour compenser l’ombrage et optimiser l’homogénéité spatiale de l’intensité pendant et après l’acquisition Les modules logiciels peuvent être installés sur le même poste de travail ou sur des postes de travail différents (Windows 10 64 bits).
Logiciel d’acquisition scanR	Configuration et interface utilisateur axées sur le flux opérationnel Procédures puissantes de mise au point automatique du logiciel pouvant être combiné au système de mise au point automatique à laser IR en option, mise au point automatique grossière et fine en deux étapes, mise au point automatique basée sur les objets ou mise au point automatique s’appuyant sur l’image Gestionnaire de plaques avec des formats prédéfinis (lames, plaques multipuits) et interface d’édition pour créer et modifier des formats personnalisés (biopuces) Correction de l’ombrage pour compenser l’ombrage et optimiser l’homogénéité spatiale de l’intensité Criblage par prises de vue à intervalle, criblage en empilement en Z, criblage multicolore (nombre illimité de canaux d’acquisition) Intégration possible dans des lignes de préparation automatisées des échantillons, p. ex. : interfaces scriptibles pour la manipulation des liquides
Logiciel d’analyse scanR	Analyse automatisée des images et des données pour les analyses standards et le développement d’analyses Analyse multicœur en ligne et hors ligne Traitement des images, analyse des images, détection des particules, extraction et calcul des paramètres Exploration, analyse, fenêtrage et classification des données cytométriques Concept de fenêtrage puissant et flexible avec détection automatique des populations Lien direct entre les points de données, les objets et les images Procédure d’utilisation du logiciel basée sur les analyses à réaliser et fonctionnalité avancée de développement de tests scientifiques
Ordinateur	Ordinateur d’imagerie (PC de dernière génération), Windows 10 64 bits
Options supplémentaires	Solution d’apprentissage profond par IA scanR Module d’analyse cinétique par prises de vue à intervalle : une approche cytométrique unique pour mieux analyser et comprendre la dynamique des cellules vivantes Module de déconvolution 3D (système d’exploitation 64 bits requis) Option confocale avec CSU-W1 de Yokogawa avec une ou deux caméras Acquisition simultanée à deux caméras Mise au point automatique à laser infrarouge (IR) s’appuyant sur le ZDC de la série de microscopes IX83 d’Olympus Robot de chargement de plaques Changeur de grossissement codé IX3-CAS Roue porte-filtres d’émission rapide pour l’imagerie à grande vitesse en configuration « Sedat » Poste de travail d’analyse scanR supplémentaire Deuxième licence pour le logiciel d’analyse scanR Affichage d’analyse scanR
Deux systèmes dans une même configuration	Peut être combinée au logiciel d’imagerie de cellules vivantes cellSens pour bénéficier de la polyvalence totale d’un système d’imagerie de pointe