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Visão geral

	Estação de triagem modular de alto conteúdo para ciências da vida A plataforma de formação de imagem com base em microscópio modular scanR oferece aquisição de imagem e análise de dados totalmente automatizadas de amostras biológicas por meio de tecnologia de deep learning. Entre em contato

Estação de triagem modular de alto conteúdo para ciências da vida

A plataforma de formação de imagem com base em microscópio modular scanR oferece aquisição de imagem e análise de dados totalmente automatizadas de amostras biológicas por meio de tecnologia de deep learning.

Entre em contato

Hardware flexível e modular

A estação de triagem scanR combina a modularidade e flexibilidade de uma configuração com base em microscópio com a automação, velocidade e produtividade operacional exigida pela triagem de alto conteúdo. Adequado para ensaios padrão e desenvolvimento de ensaio, o design modular torna a estação scanR adaptável para aplicações de laboratório de P&D ou ambientes com diversos usuários.

Sistema confocal de disco giratório

Compatível com o sistema de microscópio de super-resolução Olympus IXplore SpinSR incorporando a unidade de scanner Yokogawa CSU-W1
Os discos com base em microlentes e excitação a laser fornecem imagens confocais simples em alta velocidade

Sistema de carregamento com robô

Use com um sistema de carregamento de placa com robô para obter uma triagem de alta produtividade operacional automatizado

Sistema de incubação

Adicione qualquer sistema de incubação compatível com o IX83 para um controle rigoroso da temperatura, umidade e níveis de CO2

Sistema TIRF e FRAP (com o software cellSens)

Use com a linha Olympus IXplore e o software cellSens para realizar experimentos de formação de imagem avançados, como TIRF e FRAP

Vídeos relacionados	Software abrangente O design flexível do sistema permite que ele atenda aos requisitos para formação de imagem quantitativa e análise de imagem em biologia celular, biologia molecular, sistemas de biologia e pesquisa médica modernas. Aquisição de imagem e análise de dados totalmente automatizadas de amostras biológicas Concebido para placas com múltiplos poços, lâminas e arranjos personalizados Módulo de análise poderoso para ensaios biológicos funcionais Ideal para desenvolvimento de ensaio e triagem de alto conteúdo Acomoda células vivas e fixas

Software abrangente

O design flexível do sistema permite que ele atenda aos requisitos para formação de imagem quantitativa e análise de imagem em biologia celular, biologia molecular, sistemas de biologia e pesquisa médica modernas.

Aquisição de imagem e análise de dados totalmente automatizadas de amostras biológicas
Concebido para placas com múltiplos poços, lâminas e arranjos personalizados
Módulo de análise poderoso para ensaios biológicos funcionais
Ideal para desenvolvimento de ensaio e triagem de alto conteúdo
Acomoda células vivas e fixas

Atende às necessidades de diversos ensaios

O sistema scanR se sobressai em aplicações para descoberta de medicamentos, incluindo a exibição de efeitos bioquímicos de compostos a nível celular e alterações induzidas por medicamentos a nível da expressão gênica. A solução pode medir a apoptose, micronúcleos ou fragmentação de DNA (ensaios cometa) e abrange uma vasta gama de aplicações para triagem:

Contagem de células
Expressão gênica
Transporte intracelular
Translocação
Proliferação celular
Ensaios físicos de leucemia promielocítica (LPA)
Ensaios de infecção viral e bacteriana
Análises de ciclo celular
Triagens de arranjo celular
Localização e colocalização de proteína
Ensaios de células vivas incluindo análises cinéticas e gating das curvas de resposta resultantes
Ensaios multicores
Análise de evento rápido
Análise FISH automatizada
Análise de fluorescência em seções de tecido
Migração celular

Tela de todo o genoma em arranjos celulares para identificação de novos genes envolvidos no maquinário de transporte intracelular. Imagem cortesia do Dr. R. Peperkok, EMBL, Heidelberg, Alemanha

Tela de todo o genoma em arranjos celulares para identificação de novos genes envolvidos no maquinário de transporte intracelular. Imagem cortesia do Dr. R. Peperkok, EMBL, Heidelberg, Alemanha.

Ensaio de infecção de chlamydia trachomatis. Imagem cortesia do Dr. S. Hess, Max Planck Institute (MPI) for Infection Biology, Berlim, Alemanha.

Segmentação de células binucleadas e contagem de micronúcleos. Imagem cortesia do Departamento de toxicologia in-vitro, Fraunhofer Institute Toxicology and Experimental Medicine (ITEM), Hanover, Alemanha

Opções de módulo flexíveis

A solução scanR não atende somente os requisitos específicos de velocidade, resistência e confiança de um sistema de triagem de alto conteúdo totalmente automatizado, como também fornece uma flexibilidade sem igual com capacidades extensivas de expansão. Isso permite que o sistema scanR atenda às especificações de uma gama mais ampla de aplicações e orçamentos. Adicione módulos com as seguintes capacidades ao seu sistema:

Microscopia de autoaprendizagem com base em tecnologia de deep learning
Medição de parâmetros cinéticos
Deconvolução 3D de alta velocidade
Hardware de laser infravermelho (IV) com foco automático (com base no IX83 ZDC)
Entre outras

Entre em contato com especialistas na aplicação para personalizar o seu sistema para as suas aplicações

Deconvolução de alta velocidade

Deconvolução TruSight de alta velocidade

Comparação de campo amplo, deconvolução 2D e deconvolução 3D detectando as estruturas sutis de amostras sem comprometer a produtividade operacional.

TruFocus hardware de laser infravermelho (IV) com foco automático

O modo AF contínuo melhorado mantém o plano de observação desejado precisamente em foco, mesmo durante a adição de reagentes ou alterações na temperatura ambiente.

Microscopia de autoaprendizagem com base em tecnologia de deep learning

Microscopia de autoaprendizagem com tecnologia de deep learning

Da esquerda para a direita: previsão de posições de núcleo com IA (azul), marcação de histone 2B exibindo núcleo (verde) com proteína fluorescente verde (GFP) e transmissão de imagem de campo claro bruta (cinza).

Precisa de ajuda?

Entre em contato

Tecnologias aplicadas

Gating e classificação Os poderosos conceitos de análise de dados aplicados com sucesso à citometria são adaptados para se adequarem às demandas da análise de conjuntos de dados de imagens grandes. Os dados de imagens multidimensionais são exibidos em gráficos de dispersão bidimensionais ou histogramas unidimensionais; populações de interesse de dados agrupados podem ser selecionadas usando ferramentas gráficas. As regiões de interesse de diferentes representações podem ser combinadas com operadores Booleanos para criar esquemas de classificação complexos.	Uma abordagem de gating hierárquico permite a seleção intuitiva de populações, que também podem ser visualizadas em galerias.

Gating e classificação

Os poderosos conceitos de análise de dados aplicados com sucesso à citometria são adaptados para se adequarem às demandas da análise de conjuntos de dados de imagens grandes.
Os dados de imagens multidimensionais são exibidos em gráficos de dispersão bidimensionais ou histogramas unidimensionais; populações de interesse de dados agrupados podem ser selecionadas usando ferramentas gráficas.
As regiões de interesse de diferentes representações podem ser combinadas com operadores Booleanos para criar esquemas de classificação complexos.

Uma abordagem de gating hierárquico permite a seleção intuitiva de populações, que também podem ser visualizadas em galerias.

Comece rapidamente

Os modelos de rede neural pré-treinados incluídos permitem que você comece a usar a IA rapidamente. Usando os modelos pré-treinados, você pode começar a detectar núcleos e células na maioria das condições padrão. Mesmo células confluentes e núcleos densos podem ser distinguidos com segurança.

Medidas de controle e validação são incorporadas para ajudar a garantir a precisão e robustez dos resultados de análise da IA.

Segmentação precisa e objetos: dados brutos (à esquerda), segmentação de limite padrão (meio), segmentação de instância TruAI (à direita). A segmentação de instância separa de forma confiável objetos difíceis de distinguir e que estão muito próximos, como células ou núcleos em colônias ou tecido.

Captura de tela da imagem após aquisição de dados por scanR, demonstrando a detecção e separação de marcadores. Cortesia do Dr. R. Pepperkok, EMBL Heidelberg, Alemanha.	Detecção e análise de objeto Módulos de detecção de objeto poderosos segmentam núcleos, células ou outras estruturas. Selecione múltiplos algoritmos de detecção e adapte-os aos objetos de interesse. Com base nos resultados de segmentação, as características a serem extraídas podem ser selecionadas a partir de uma lista de mais de 100 parâmetros de objeto. Facilita uma vasta gama de ensaios com base em célula.

Captura de tela da imagem após aquisição de dados por scanR, demonstrando a detecção e separação de marcadores. Cortesia do Dr. R. Pepperkok, EMBL Heidelberg, Alemanha.

Detecção e análise de objeto

Módulos de detecção de objeto poderosos segmentam núcleos, células ou outras estruturas.
Selecione múltiplos algoritmos de detecção e adapte-os aos objetos de interesse.
Com base nos resultados de segmentação, as características a serem extraídas podem ser selecionadas a partir de uma lista de mais de 100 parâmetros de objeto.
Facilita uma vasta gama de ensaios com base em célula.

Controle de qualidade imediato As imagens e objetos estão reciprocamente vinculados aos seus respectivos pontos de dados: Clicar em um ponto de dados carrega a imagem relevante na janela de exibição e destaca o objeto em questão. Clicar em um objeto na imagem exibe os destaques dos pontos de dados relacionados nos gráficos de dispersão e histogramas. Criar uma exibição de galeria de todas as imagens de população de dados selecionadas ou identificadas para possibilitar uma comparação direta e visual de conjuntos de imagens maiores com informações relevantes.	Os resultados são visualizados em mapas de calor ou exportados para tabelas. Exiba facilmente uma visão geral de poços cheios.

Controle de qualidade imediato

As imagens e objetos estão reciprocamente vinculados aos seus respectivos pontos de dados:

Clicar em um ponto de dados carrega a imagem relevante na janela de exibição e destaca o objeto em questão.
Clicar em um objeto na imagem exibe os destaques dos pontos de dados relacionados nos gráficos de dispersão e histogramas.

Criar uma exibição de galeria de todas as imagens de população de dados selecionadas ou identificadas para possibilitar uma comparação direta e visual de conjuntos de imagens maiores com informações relevantes.

Os resultados são visualizados em mapas de calor ou exportados para tabelas. Exibir uma visão geral de poços cheios é simples.

Os resultados são visualizados em mapas de calor ou exportados para tabelas. Exiba facilmente uma visão geral de poços cheios.

Vídeos relacionados	Aquisição multinível Após uma análise prévia inicial, o software de análise scanR pode identificar todos os potenciais objetos de interesse. Em um processo de trabalho automatizado, os resultados da análise são usados para analisar seletivamente os objetos de interesse em uma segunda tela específica.

Aquisição multinível

Após uma análise prévia inicial, o software de análise scanR pode identificar todos os potenciais objetos de interesse. Em um processo de trabalho automatizado, os resultados da análise são usados para analisar seletivamente os objetos de interesse em uma segunda tela específica.

Medindo parâmetros cinéticos com o Módulo cinético Classifique células vivas, núcleos e outros objetos de acordo com as suas propriedades de variação temporal. Avalie curvas de rastreamento com base em valores (parâmetros estáticos médios, tal como intensidade, área, proporção, fator de forma etc.) medidos com o passar do tempo. Avalie e analise parâmetros estáticos, como a intensidade ou a proporção de marcadores de fluorescência, posição, tamanho ou forma com o passar do tempo. As curvas são condensadas em valores de característica única (parâmetros cinéticos). Represente graficamente os parâmetros cinéticos em histogramas de 1D ou 2D e separe as populações em regiões de interesse com base nas suas propriedades temporais específicas.	Células hES expressando o biosensor FUCC (CA). Cortesia da Dra. Silvia Santos, The Francis Crick Institute, Londres, Reino Unido.

Medindo parâmetros cinéticos com o Módulo cinético

Classifique células vivas, núcleos e outros objetos de acordo com as suas propriedades de variação temporal.
Avalie curvas de rastreamento com base em valores (parâmetros estáticos médios, tal como intensidade, área, proporção, fator de forma etc.) medidos com o passar do tempo.
Avalie e analise parâmetros estáticos, como a intensidade ou a proporção de marcadores de fluorescência, posição, tamanho ou forma com o passar do tempo.
As curvas são condensadas em valores de característica única (parâmetros cinéticos).
Represente graficamente os parâmetros cinéticos em histogramas de 1D ou 2D e separe as populações em regiões de interesse com base nas suas propriedades temporais específicas.

Células hES expressando o biosensor FUCC (CA). Cortesia da Dra. Silvia Santos, The Francis Crick Institute, Londres, Reino Unido.

	Combina formação de imagem avançada e análise de alto conteúdo Execute o software de formação de imagem de células vivas cellSens no mesmo sistema que a solução scanR para poder usar a mesma configuração simultaneamente para triagem e formação de imagem avançada. Obtenha detalhes de imagem de alta qualidade nas aplicações de triagem mais exigentes usando algoritmos de deconvolução iterativa restrita 2D e 3D. Os algoritmos rápidos e fáceis de usar removem os borrados fora de foco e o fundo para revelar detalhes estruturais importantes. Útil para análises aprofundadas que exigem detalhes estruturais de alta resolução.

Uma história em dois sistemas

Combina formação de imagem avançada e análise de alto conteúdo

Execute o software de formação de imagem de células vivas cellSens no mesmo sistema que a solução scanR para poder usar a mesma configuração simultaneamente para triagem e formação de imagem avançada.
Obtenha detalhes de imagem de alta qualidade nas aplicações de triagem mais exigentes usando algoritmos de deconvolução iterativa restrita 2D e 3D.
Os algoritmos rápidos e fáceis de usar removem os borrados fora de foco e o fundo para revelar detalhes estruturais importantes.
Útil para análises aprofundadas que exigem detalhes estruturais de alta resolução.

Microscopia de autoaprendizagem

A microscopia de autoaprendizagem abre novos caminhos para a análise de alto conteúdo. As aplicações variam de segmentações de imagem e tarefas de classificação que eram anteriormente impossíveis até análises quantitativas de níveis de sinal extremamente baixos, simplificando protocolos de coloração, análises sem marcadores, entre outras.

Microscopia de autoaprendizagem

Exemplo de processo de trabalho usando microscopia de autoapredizagem para gerar um modelo de IA para análise sem marcadores de imagens de campo claro desafiadoras. O núcleo celular de células HeLa são marcadas com GFP na fase de treinamento para mostrar ao sistema como analisar imagens de campo claro.

Leia o livro branco

Uma nova forma de pensar

Exemplo de aplicação: segmentação robusta de núcleos celulares com diferentes níveis de sinal, possibilitando uma redução significativa da exposição de luz para análise quantitativa.

O usuário tem total controle do design do experimento de treinamento.

Diversas condições de análise desafiadoras podem ser abrangidas durante a fase de treinamento.

O protocolo de análise aprendido da IA pode ser validado aprofundadamente e facilmente com a interface de exploração e análise de dados única do software.

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Especificações

Estativa do microscópio	Microscópio invertido Olympus IX83, um ou dois pisos Platina motorizada, Märzhäuser SCAN IM 120 × 80 para o microscópio Olympus IX83
Opções de LEDs fluorescentes	Lumencor SpectraX: 6 canais de LED independentes CoolLED pE-300ultra: 3 canais de LED independentes Filtros passa-banda otimizados para a aplicação Vida útil > 20.000 horas
Opções de iluminação de luz transmitida	Iluminação de luz transmitida somente para inspeção visual (sem triagem de luz transmitida) Iluminação de luz transmitida para triagem e inspeção visual incluindo obturador rápido (com suporte para triagem de luz transmitida) DIC opcional (contraste de interferência diferencial) ou contraste de fase
Controle de hardware e sincronização do sistema (opcional)	Controlador em tempo real com CPU adicional independente do sistema operacional do PC de formação de imagem Resolução temporal: 1 ms Precisão de tempo: < 0,01 ms Aquisição de múltiplas tarefas com sincronização de hardware (controle de iluminação, filtros de emissão, obturadores etc.) Controle de câmera preciso via gatilho externo
Opções de câmera	Hamamatsu ORCA-Flash 4.0 V3, câmera sCMOS refrigerada de alta sensibilidade com chip sensor grande de 18,8 mm (0,74 pol.) Hamamatsu ORCA-Flash 4.0 LT, uma câmera sCMOS econômica com chip sensor grande de 18,8 mm (0,74 pol.) Hamamatsu ORCA-Fusion, câmera sCMOS com chip sensor grande de 21,2 mm (0,83 pol.) Hamamatsu ORCA-Fusion BT, câmera sCMOS de ruído ultrabaixo com chip sensor grande de 21,2 mm (0,83 pol.)
Opções de objetiva (compatível com as objetivas Olympus X Line)	Objetivas para substratos "finos" (0,1 mm–0,2 mm [0,004 pol.–0,008 pol.]), lamínulas e placas com parte inferior de vidro (2X, 4X, 10X, 20X, 40X, 60X, 100X) Objetivas para substratos "espessos" (~1 mm [0,04 pol.]), placas com parte inferior de plástico e lâminas (2X, 4X, 10X, 20X, 40X, 60X, 100X) Objetivas de contraste de fase para substratos "finos" (0,1 mm–0,2 mm [0,004 pol.–0,008 pol.]), lamínulas e placas com parte inferior de vidro (10X, 20X, 40X) Objetivas de contraste de fase para substratos "espessos" (~1 mm [0,04 pol.]), lamínulas e placas com parte inferior de vidro (10X, 20X, 40X)
Conjuntos de filtros	Conjuntos de filtros de banda única (especificações conforme solicitado) Conjuntos de filtros multibanda (especificações conforme solicitado)
Sistema scanR Software	2 módulos de software independentes: software de aquisição scanR e software de análise scanR Processo de trabalho de correção de sombreado para compensar o sombreado e otimizar a homogeneidade da intensidade espacial durante a pós-aquisição Os módulos de software podem ser instalados nas mesmas estações de trabalho ou em estações diferentes (Windows 10 de 64 bits)
Aquisição scanR Software	Configuração e interface do usuário orientadas para o processo de trabalho Procedimentos de software de foco automático poderosos que podem ser combinados com função de hardware de foco automático de laser IV opcional, foco automático grosso e fino de 2 etapas, foco automático com base em objeto ou foco automático com base em imagem Gerenciador de placa com formatos predefinidos (lâminas, placas multipoços) e interface de edição para criar e editar formatos personalizados (arranjos marcados) Correção de sombreado para compensar o sombreado e otimizar a homogeneidade da intensidade espacial Triagem com lapso de tempo, triagem com pilha Z, triagem multicor (número ilimitado de canais de aquisição) Compatível com integração em linhas de preparação de amostras automatizadas, por ex.: interfaces com possibilidade de criação de script para manuseio de líquidos
Análise scanR Software	Análise automatizada de imagem e dados para ensaios padrão e desenvolvimento de ensaios Análises multipolares online e offline Processamento de imagem, análise de imagem, detecção de partículas e extração e cálculo de parâmetros Exploração, análise, gating e classificação de dados citométricos Conceito de gating flexível e poderoso incluindo detecção automatizada de população Ligação direta entre pontos de dados, objetos e imagens Processo de trabalho com base em ensaios e funcionalidade de desenvolvimento de ensaio científico avançada
Computador	Computador de formação de imagem (PC de última geração), Windows 10 de 64 bits
Opções adicionais	Solução de IA scanR com deep learning Módulo de análise cinética com lapso de tempo – uma abordagem citométrica única para analisar e compreender melhor a dinâmica de células vivas Módulo de deconvolução 3D (requer um sistema operacional de 64 bits) Opção confocal com Yokogawa CSU-W1 com uma ou duas câmeras Aquisição simultânea de duas câmeras Função de hardware de foco automático de laser IV com base no ZDC da linha de microscópios Olympus IX83 Robô de carregamento de placa Seletor de ampliação codificado IX3-CAS Roda de filtro de emissão rápida para formação de imagem de alta velocidade na configuração "Sedat" Estação de trabalho de análise scanR adicional Segunda licença para o software de análise scanR Visualizador de análise scanR
Dois sistemas em uma configuração	Pode ser combinado com o software de formação de imagem de células vivas cellSens para versatilidade total de um sistema de formação de imagem avançado